现在对于子宫内膜异位的治疗，一般情况下用的一些药就是一些激素一类的药物，主要就是一般前列腺素合成激素合成的一些酶，比如说现在最经常用的就是吲哚美辛，还有就是还要用一些孕激素，不过一般情况下这种治疗的方法，一般情况下主要就是针对于那些比较年轻并且还有就是要生孩子的人才用现在方法。
药物治疗，主要是口服激素，即假孕和假绝经疗法，也就是人为的因素造成闭经和绝经，但是这就会带来很多的副作用，会引起肝肾功能的损伤。另外，一旦停止服药以后，复发率就会很高，而且还会反弹。就拿痛经来举个例子。吃药之前痛经，一旦停止服药之后反而会痛得更厉害。而卵巢囊肿反而生长的速度比用药以前还要快。 药物治疗的主要药物是：丹那唑、内美通、促性腺激素释放激素激动剂、三苯氧胺、合成孕激素、中医中药等。
所以说药物治疗不是对于每一个的子宫内膜异位的病人都是可以用的，有一些人要进行手术治疗才可以，一般情况下就是做一些腹腔镜下的手术，或者是经过肚子的手术，还有就是一般情况下手术治疗也是要分类的，一般情况下主要就是分为保留生育能力的手术，还有就是不保留生育能力的手术，但是在年龄大的情况下可进行不保留手术的，因为如果是保留手术的话，一般情况下都是会复发的，所以最好就是不保留手术。
治疗子宫内膜异位的药，一般情况下主要就是一些激素，比如说一些前列腺素的药吲哚美辛，还有就是一些孕激素的药，还有就是也可以用一些丹那唑，这样一来就是会出现假绝经的情况，一般情况下子宫内膜异位的原因，很有可能就是因为卵巢的雌激素的引起的，所以绝经以后会好一些。