在进行子宫内膜移位手术时，建议挑选正规的医疗机构，与医生交流，并定制适合的手术方案，手术前需要先进行部分麻醉，这样可以减少手术期间的疼痛。如果子宫内膜异位症在卵巢异位，操作时间约为45分钟，若是导致子宫肌层腺肌病，就需要进行子宫切除术，手术时间约1小时，术后有必要定期检查。
腹部子宫内膜异位症是指子宫内膜异位症在腹壁形成部分肿块，并随着月经周期的周期性疼痛，肿块逐步增大，需要手术治疗，手术是指切除肿块，切除异位病灶后部分缝合切除部位。一般异位病变不会进入患者的腹腔，因此对腹腔内的器官，如胃肠功能没有明显影响，只需腹部切除，手术后休息足够的时间。正常情况下，腹部切除愈合时间为7天，病症严重愈合时间可能延长到15天。
如果通过手术治疗子宫内膜异位症，所需时间不是特别长，可以在几个小时内结束。然而手术前需要进行某些准备和检查，在身体条件容许的情况下进行手术，手术当天需要空腹麻醉，手术可在麻醉后不久结束。术后需住院2-3天，身体状况稳定后，才能离开医院，在此期间，应该注意调整饮食，以避免感染。
子宫内膜异位引起的巧克力囊肿，不只手术时间长，术后还要给予相应的药物治疗，常用的是服用达非林3-6个月。因此，一旦发生子宫内膜异位症，应进行相应的治疗，毕竟这会导致痛经，手术后需要休息7-15天。
根据以上介绍认为，子宫内膜异位手术后一段时间，需要去医院复查，特别是女性子宫内膜异位于卵巢并导致卵巢巧克力囊肿，有必要通过腹腔镜微创手术将其切除。术后恢复时间大多在半个月左右，部分女性甚至超过一个月，期间需要肌注曲普瑞林，以避免异位疾病的复发。
