卵巢囊肿和卵巢畸胎瘤都属于卵巢方面的病变，不过这是两种不同的疾病，二者有一定的差异。
卵巢囊肿属于囊肿性疾病，通常20岁到50岁的育龄期女性，或生育过的女性发生的几率会比较高。卵巢囊肿由单侧、双侧发生的，有囊性、实性、良性和恶性等不同的性质，患者的腹部会出现大小不同的肿块，良性的卵巢囊肿还可以从盆腔当中移动到腹部，一般不会出现疼痛，但是如果是恶性的卵巢囊肿是不会活动的，稍微一压就会有明显的疼痛。卵巢囊肿治疗需要根据囊肿的位置、大小以及有无生育要求等，选择合适的方法治疗，很多可通过切除的方法进行彻底治疗。
卵巢畸胎瘤是卵巢组织的细胞发生异常增生所导致的，是一种集聚形成的肿瘤，通常在内分泌旺盛的生育阶段发生的比较多，但是也有的刚出生的女宝宝，或八九十岁的老妇人。一般属于良性的，也有少数未成熟的畸胎瘤在增长的过程中恶变的几率会高一些，可能会导致卵巢囊肿或癌变出现。卵巢畸胎瘤发现之后应尽早手术，目前可以通过腹腔镜的方式来进行。
卵巢囊肿和卵巢畸胎瘤属于不同的疾病，但是都可能会对患者造成危害，都可能会恶变，因此一旦发现之后，就应该尽早进行积极正规的治疗。