卵泡和卵巢囊肿属于两种不同的性质。一般来说，卵巢囊肿是指卵巢上的囊性肿块，大多数是良性的，一小部分是恶性的。这种肿瘤更有可能是病理性的。卵泡也在卵巢上，是囊性的，但它是正常的卵巢组织，不是病理性的。
卵巢囊肿可能是卵泡，但是如果不确定是否为卵泡，可以进行复查确诊。如果不确定是囊肿的时候，就要先把卵泡排除，可以在做了B超后过几天再做一次，如果是卵泡它会增大或者已经排了(破裂后看不到了) 那就说明不是囊肿。卵泡和囊肿最大的鉴别就在于卵泡的生成、发育、破裂在十几天内就可以完成，然后消失。
卵巢囊肿是女性的常见病和多发病，是一种良性肿瘤，可发生于任何年龄阶段，通常见于中年妇女。分为：良性卵巢肿瘤包括浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤和良性囊性畸胎瘤。卵泡是滤泡，只有当卵泡发育到一定程度并在破裂后排卵时，才能怀孕。如果卵泡看不清楚，可能是已经排卵了。