右侧卵巢囊肿一般可以分成生理性卵巢囊肿和病理性的卵巢囊肿。生理性的卵巢囊肿是由于体内激素水平周期性变化所引起的，比如卵巢黄体囊肿是由于黄体内的毛细血管出血，血液流进黄体腔中形成的囊肿。病理性的卵巢囊肿又分为良性和恶性，与遗传因素、接触有害化学物质等有关。常说的巧克力囊肿是子宫内膜异位症，是由于体内激素水平紊乱引起的。
生理性囊肿是在月经后半期出现的，囊肿大小常常小于5cm，这种情况，在月经以后可以消失，所以称之为生理性囊肿，和生理周期有关联，而且不是一个真性囊肿。一般来讲出现卵巢一侧的小囊肿，需要辨别是真性囊肿还是生理性囊肿，如果怀疑生理性囊肿，可以三个月内月经后复查，如果囊肿消失了，就称之为生理性囊肿。
如果卵巢囊肿较大或出现合并症，如扭转、破裂或恶变时才有症状，多在检查时发现，而恶性肿瘤早期可以没有症状，晚期则因局部的蔓延或腹水，可以出现腹胀以及腹部包块的情况，甚至恶病质。病理性的卵巢囊肿由于原因不清，通常没有预防的方法，而定期检查是发现病理性的卵巢囊肿的最好方法。