(一)发病原因
白塞病为自体免疫性疾病，病因尚不清。白塞病是其伴发精神障碍发病的主要因素，导致精神障碍的脑功能紊乱继发于白塞病。然而并非患白塞病的全部发生精神障碍，故白塞病并非为发生精神障碍的惟一原因。可能尚有其他因素与精神障碍的发生有关，如其他生物学因素，包括患者的性别、年龄、遗传因素、人格特征，以及既往的神经精神病史等;心理因素则包括应激状态、长期的心理矛盾等;环境因素，如居住拥挤，环境嘈杂、潮湿，空气污染等等。以上因素均可成为白塞病伴发精神障碍的促发因素。
(二)发病机制
神经精神症状的发生机制尚不清。根据病理组织所见，主要为血管周围及脑膜细胞浸润及炎性水肿及弥漫性胶质细胞增生，病损以脑干多见(约占95%)，主要侵犯脑桥、中脑、内囊等部位。