寄生在人类结肠中的阿米巴原虫主要有四种，其中只有溶组织内阿米巴与人类疾病有关。溶组织内阿米巴原虫有两个种：一为致病型溶组织内阿米巴（entamoebahistolytica），另一为共栖型迪斯帕内阿米巴（entamoebadispar），两者的形态虽然相同，但其抗原性、基因结构和致病性完全不同。后者为非侵袭性阿米巴，无毒力，感染后无症状；前者可致侵袭性病变，人类阿米巴病即是由致病型溶组织内阿米巴感染所致。

溶组织内阿米巴生活史一般分包囊期和滋养体期。包囊是阿米巴的传染阶段，而滋养体是致病阶段。包囊见于慢性阿米巴病患者或包囊携带者的大便中，人的感染途径多为食入被包囊污染的食物和水而引起。包囊囊壁具有抗胃酸作用，能安全地通过胃而到达回盲部，在肠液的消化作用下脱囊而出，发育成为小滋养体。小滋养体直径约10～20m，有一个细胞核，在适合条件下其分裂繁殖并随粪便下移至结肠，侵入肠壁组织，吞噬红细胞和组织细胞碎片变为大滋养体。大滋养体直径为20～40m，胞浆外质透明，内质浓密，其中可含有糖原、被吞噬的红细胞和组织细胞碎片。