1.就地隔离避免接触
早期发现传染源，凡发现手足口征候的孩子，不要再送托儿所、幼儿园;隔离治疗,分开食宿，用具、玩具应分开;以免感染其他儿童。
2.把住病从口入关，防密切接触
EV71感染主要通过唾液、疱疹液、粪便污染的食物和物品密切接触传播，儿童和成人都可能感染。避免粪便、口鼻分泌物污染水与食物，彻底处理好孩子的粪便排泄物，尿布要洗净消毒再用，孩子的奶瓶、食具也要经常消毒。
3.养成卫生习惯
教育孩童、学生自幼养成卫生习惯，改掉吮手指的习惯，远离垃圾及不洁环境;养成游戏后、饭前、便后一定彻底洗手的习惯。大人感染后没有症状，成为隐性传染源，更危险。
4.强化环境卫生
对幼托机构的环境及玩具、公共游泳池等必须严格消毒。注意粪便无害化处理，绝不允许污染用水。
健全疫情报告制度。凡出现发热、感冒或呼吸道症状，或发现手足口疱疹皮疹病儿，应速去医院就诊。
5.注意卫生，远离病毒
对于即将来临之肠病毒流行高峰期(六～九月)，家中有15岁以下儿童之家长应提高警觉，做好预防措施。
6.提高人体免疫力，抵抗病毒
病毒流行季节，除了要远离病毒外，加强自然免疫力以抵抗病毒也是必须的。这就要求我们适当增加新鲜蔬菜、水果的摄人量。