病因不详。研究提示发病与感染有关如克雷白杆菌属(campylobacter)感染该菌与HLA-B27可能有抗原残基间的交叉或共同结构，但尚难做出结论。

发病机制：骶髂关节炎是强直性脊柱炎的病理标志，其早期变化可见滑膜增生和淋巴样细胞及浆细胞积聚淋巴样滤泡形成，以及含有IgG、IgA和IgM的浆细胞。