病毒性脑炎和癫痫都是发生于人体大脑部位的病变，对这二者并不十分了解的人，很容易将这两种疾病混为一谈。但从根本上来讲，病毒性脑炎和癫痫在发病原因、致病机理和临床表现等具体方面，均有较为明显的差异，需注意区分。
病毒性脑炎发生的原因是病毒感染，埃可病毒、脊髓灰质炎病毒等感染人体脑实质，均有可能引发病毒性脑炎。相比起病毒性脑炎，癫痫的发病原因则较为复杂，脑部疾病和全身系统性疾病的发生，都有可能导致癫痫的发作。除此之外，遗传因素也是癫痫极为常见的病因之一。
在发病机制方面，病毒性脑炎和癫痫也存在较大差异。当病毒经粪口途径或呼吸道分泌物在人群中传播时，病毒进入人体入侵脑部，便有可能造成病毒性脑炎的爆发。癫痫的发病机制与病毒性脑炎并不相同，它的发病大多与神经递质异常传递、神经胶质细胞功能异常、离子通道功能异常等联系紧密。
在临床表现方面，病毒性脑炎会致使患者出现偏瘫或视力丧失，极个别患者还会因疾病而出现瘫痪、失语、小脑共济失调等不同程度的症状表现，但这些症状在病毒性脑炎治愈后大部分都会消失。大多数癫痫患者，以突发性的意识丧失和全身强直抽搐为临床特征，长期频繁的癫痫发作，很容易使患者的智力和身心产生较为严重的危害，然而这些危害往往是不可逆的。
不管是病毒性脑炎还是癫痫，这两种疾病都需要进行相关检查后方可确诊。由于这两种疾病均是发生于人体脑部的严重性疾病，一经确诊，患者及家属需充分重视并积极配合治疗，争取将疾病对身体健康的影响降到最低。