扁桃体结石较小，一般不会疼，如果扁桃体结石较大，可能会伴随疼痛的症状，应到正规医院就诊，根据诊断结果采取合适的治疗措施。
扁桃体结石的形成主要与饮水不足，或者饭后没有及时漱口等原因造成的，通常会造成异物聚集在扁桃体的隐窝部位形成结石，而在患有慢性扁桃体炎以及鼻窦炎等器质性病变之后，治疗不及时，炎症分泌物刺激到咽喉部位也会产生结石。扁桃体结石是否疼痛多数与扁桃体结石的大小有很大的关系，正常情况下结石较小，炎症较为轻微，可能会伴随咽喉部位不适感，也有可能伴随口臭以及扁桃体肿大等现象，但并不会伴随疼痛。
如果扁桃体结石存在受凉、感冒、劳累等刺激的情况下，可能会导致扁桃体炎的症状加重，会造成咽喉部位反复疼痛、咽部不适感和咽部堵塞感，而且扁桃体结石较大的患者因为结石比较大，容易卡在扁桃体的凹陷处，周围产生炎症反应或者存在化脓性感染的状况，也有可能伴随反射性耳痛、吞咽困难、口臭、喉咙发炎、局部疼痛等症状。
平时需要注意做好护理工作，扁桃体结石的患者可以到正规医院就诊，由专业的医师通过钳子夹取减轻局部疼痛的症状，如果情况持续没有缓解，可以选择扁桃体切除手术治疗。