(一)治疗
结合病史及其他表现提示为本病后，早期应用抗凝药物及解除血管痉挛药，可采用肝素抗凝，尿激酶溶栓，右旋糖酐及中药活血化淤治疗。在中药选择上，由于病人不能口入，可应用三七总皂苷(血塞通)或灯盏花注射液静脉输入。肝素抗凝一般5～7天，尿激酶7～10天，在停用肝素前2天给予华法林，停用肝素后华法林改为维持量，抗凝治疗至少3～6个月，可以收到较好效果。但在保守治疗期间要严密观察，一旦出现肠坏死迹象，需及时手术。静脉血栓形成往往累及分支，因此坏死可能仅及一段肠管，但血栓有蔓延的可能，术后发生瘘的机会亦多，因此实施静脉切开取栓术的可能性极小。也有报道应用术中经肠系膜上动脉行局部溶栓治疗效果更理想。本病切除的范围应广一些，包括含有静脉血栓的全部系膜。受累小肠长度不足1/2时，将受累肠管及其系膜全部切除，切除范围适当放宽。受累小肠长度大于1/2或更多时，严格控制切除范围。术后易再有血栓形成，常用右旋糖酐40(低分子右旋糖酐)、肝素、尿激酶、丹参等药物，7～14天后改为口服抗凝药物维持3～6个月。
(二)预后
肠系膜静脉血栓形成经手术及抗凝治疗后，预后较动脉栓塞为好，病死率在20%左右。