其实检查肠道的方法有很多，但临床上最常用的无疑就是肠镜检查，很多人比较惧怕肠镜检查，毕竟它属于一种外来物入侵的检查，实际上这种害怕是多余的，肠镜检查虽然会引起不适，但并没有其他的副作用，而且检查时间较短，不需要检查的人承担太多痛苦。
检查肠道的方法不只有肠镜，其他检查也是可以的。但肠镜检查的时候使用频率要比钡餐检查高的多，肠镜检查是检查消化道最刺激的方法，不需要进行化验，做参数对比，所以目前来说，检查肠道的方法最好使用肠镜，他的准确率也是最高的，使用其他方法检测可能会出现偏差。
肠镜检查非常直接，花费的时间最少，肠道检查所使用的镜头都是经过严格消毒的，而且能观察到肠道里面的各种问题，至于其他的肠道检查，像钡餐以及X光检查，都属于间接检查方法，有的时候，腹部的检查也会用到CT，但是比较微小的创伤，ct检查很难发现。
肠镜检查没有太严重的痛苦，但是接受检查的人多少会感觉到一点不适，肠镜检查属于入侵式检查，探头多少都会刺激到肠道，让病人感觉到不舒服，如果是对于肠道检查比较敏感的病人，可以考虑使用无痛肠镜检查，他在正式检查前会注射麻药，病人会短暂失去知觉，不会感到不适。
检查肠道也可以选择其他的方法，如果病人实在太过惧怕肠镜检查，那么可以请求医生换一种检查方式，不过相对来说，其他的检查方法准确率并不高，只能大概判断疾病的种类，无法确切病症的严重程度，而且往往需要对检查结果进行化验分析，花费时间较长。