MODS由于是感染、损伤、缺血等因素刺激引起的机体炎症反应失控所导致的器官损伤，多种介质参与发病，它实质是一种“介质病”，在细胞因子之间、细胞因子与其他介质之间存在着复杂的连锁反应和网络联系。阻断这些因子的产生和作用以预防发生MODS或在MODS已经发生后阻断其序贯性进展，为治疗MODS开辟了新的途径，但目前还没有任何一种疗法能作为解决MODS所有问题的万能钥匙(magic bullet)，多种方法或制剂的综合疗法的应用(即鸡尾酒或综合疗法cooktail therapy)是最好的治疗。
MODS一旦发生，病情进展迅速，由于病因复杂，各器官相互关联，治疗矛盾较多，治疗十分困难，有些治疗可能还是医源性致病因素，治疗不当或治疗过度均可加重病情，关键在于早期诊断，及时合理治疗，既要注意病因及其共性的治疗原则，又要重点加强靶器官功能障碍的监护和治疗。MODS的治疗必须采取综合和序贯治疗方法，又要防止医疗干预过度。有SIRS表现时，即应注意MODS的诊断，不要过分追求MOF的诊断标准，因为一旦发生MOF则可能已至病情末期。凡有可能引起MODS/MOF的3个主要环节，即侵袭(严重感染、休克、严重创伤或大手术后)、免疫防御功能下降、医源性因素等引起病情加重时，均应早期采取防治措施，阻止单一脏器功能障碍(monorgan dysfunction)或衰竭向多脏器功能障碍/衰竭发展。
应随着病情的进展，评估器官功能障碍好转或严重程度，以便及时修正治疗计划，有条件应进行血流动力学监测，MODS/MOF无统一的标准治疗常规，所采取措施，主要是针对各器官功能障碍的对策组合，同时还要不断分析观察研究在治疗已发生功能障碍/衰竭器官时，此种治疗措施对其他脏器所产生的影响(如机械通气对心脏输出功能的影响)，并采取必要措施减少其影响。国外治疗趋势是：①输入保护性因子或应用针对损伤性细胞因子的单克隆抗体，以调节免疫功能和减轻炎症反应;②输入前列腺素、血小板活化因子，以调节特异性和非特异性环氧乙酸代谢及营养;③应用净化治疗，以过滤或吸收毒素及代谢产物;④扩容时应用3%～4%高张盐水，以减轻间质和细胞水肿，从而改善组织缺血及低氧血症，并降低MODS的发生与发展;⑤应用β-内啡肽拮抗剂及类固醇，以改善外周血管对肾上腺素刺激的反应;⑥非洋地黄类正性肌力药物，血管扩张药联合应用不仅可改善心血管功能，且可改善循环，有利组织灌注;⑦应用己酮可可碱(Pentoxifylline)降低血液黏稠度，改善微循环血流量及活性细胞在血管内皮的黏附性，以阻止炎症介质释放;⑧应用氯化镁ATP复合物静脉输入，可改善微循环血流及细胞内线粒体镁的水平、ATP贮存和细胞代谢功能;⑨氧自由基清除剂如黄嘌呤、奥古蛋白(超氧化物歧化酶)、过氧化氢酶、谷胱甘肽还原酶、维生素E、大剂量维生素C及甘露醇等，可防止或预防低氧引起的细胞损伤;⑩使用钙通道阻滞药以减轻细胞内钙超载等。
1.一般措施
(1)重点观察和监护：凡危重疾病尤其感染性休克、严重感染、败血症等，均应重点进行观察和监护，重点观察项目是体温、呼吸、脉搏、心率(包括心律、心音强弱)、血压、尿量、血小板计数、电解质、心电图、血气分析、中心静脉压、肝肾功能和凝血及纤溶系统指标等，根据病情变化，随时调整治疗方案，有条件和必要时可作血流动力学监测和Swan-Gang导管监测肺毛细血管楔压。
(2)对症治疗：迅速建立静脉通道(严重休克静脉穿刺难以成功时可行骨髓内输液)，维持有效血容量，保持电解质平衡，矫治贫血及低蛋白血症、脱水、酸中毒等，并应早期注意能量供应。
(3)评价器官功能：了解既往病史，对共存症如先心病、营养不良、免疫低下及各系统器官是否产生障碍的评价，随时注意有可能发生功能衰竭的器官系统，给予积极支持疗法。
2.控制感染 感染是MODS的主要原因之一，控制感染是治疗MODS的关键。首先根据感染的途径，如呼吸道、神经系统、腹腔内或泌尿道等，分析可能的致病菌，选用对革兰阴性或阳性细菌有杀菌能力的抗生素，一般两种联合应用，然后根据血、尿、体温和感染灶致病菌培养结果及药敏试验，选用敏感抗生素，如发现脓肿或脓胸应立即切开或穿刺排脓。
3.控制休克 休克是MODS常见病因，不但要纠正显性失代偿性休克(cover decompensated shock)，而且要及早注意纠正隐性代偿性休克(cover compensated shock)，一旦休克发生要注意休克的分型，及时稳妥扩容(心源性休克应在改善心功能基础上慎重补充血容量，不能迅速扩容)，在扩容基础上可应用血管活性药物，以改善微循环，增加组织血液灌流。
4.清除坏死组织和感染灶、控制脓毒症使用有效的抗生素控制感染，但对肠道厌氧菌需注意保护，因为这是一道有效抑制肠道需氧致病菌黏附黏膜并获得入侵位点的生物学屏障，因此，除非有明确指征，一般不宜随便使用抗厌氧菌的抗生素，尤其是主要经胆道排泄的抗生素。对坏死组织要及早彻底清除。
5.早期脏器功能支持 凡严重感染、休克、创伤均应首先保持充分的循环血量，从而早期纠正血容量不足和微循环障碍是防止MOF发生发展的重要因素，须迅速应用晶体液扩容，然后根据情况应用胶体液，如血细胞比容低于30%，可适当应用全血，以助携氧和细胞的供氧。
同时尚应注意心输出量，有条件时可插Swan-Gang导管，测量肺动脉楔压，对预防心肺功能衰竭有重要作用。心脏支持应以补充血容量开始，如有前后负荷增加或心脏收缩功能减退，可慎重应用正性肌力药或血管活性药，多巴胺和多巴酚丁胺是常用的血管活性药，当血容量补充后，周围循环仍不能改善，而中心静脉压上升时，提示血容量已足，不能继续扩容，而需用血管扩张剂和改善心功能的药物。
6.保护肾功能 血容量补足后，必须注意尿量，保护肾功能。襻利尿剂对防止急性肾衰有良好作用，在补充血容量后，如尿量仍不增加，且血尿素和肌酐上升，可应用呋塞米(速尿)1mg/kg，半小时静注1次，剂量加倍，直至尿量满意为止，4～5次，总量不超过10mg/kg。若仍无利尿作用，则再增加剂量也无益，应寻找原因。在充分补充血容量的同时，早期应用呋塞米，常可使少尿性肾衰逆转为多尿性。肾衰，所以应反复测定尿量和尿液成分。对脓毒症患儿应特别重视，因此类患儿即使尿量足够但尿钠降低，说明肾脏虽可排出正常尿量，但正在通过储钠以维持血容量，因此即使尿量正常，仍需继续输液以增加血容量，同时应注意避免应用有肾毒性的药物，以维护肾功能。
7.营养支持 代谢紊乱、能量危机(Energy Crisis)是产生MODS及造成患儿死亡的重要因素，美国一项统计ICU住院患儿15%～20%可出现急性蛋白营养不良(Acute Protein-Energy Malnutrition)，营养支持可控制能量危机及代谢紊乱，从而减少并发症。MODS/MOF是一种高代谢状态，特征为静息状态能量消耗增多，氧消耗、心输出量、二氧化碳增多。氨基酸作为能量基质而被代谢，尿氮排出增加，可导致严重的蛋白分解，故必须注意热能补给和氮平衡，早期进行营养和代谢支持，提供足够热卡，减少氨基酸作为能量消耗，减少肌肉蛋白质的分解代谢，促进蛋白质合成，防止营养和代谢紊乱，支持各脏器系统的功能。病危不能进食时，应行胃肠外营养，但注意不可补充过多非蛋白热量，否则可导致肝脂肪变，高渗性昏迷，而且可干扰巨噬细胞功能。
8.防止医源性疾病 注意在加强治疗中的医源性损害，如输液不宜过多过快，以防产生心衰、肺水肿;避免过多应用氯化钠，尤其碳酸氢钠，因为在严重肺功能不全情况下，大量输入碳酸氢钠可使PaCO2增高，导致呼吸性酸中毒及pH值下降，肺部有损伤及休克患儿，不要不适当的输注人血白蛋白或其他血液制品，避免使用对器官毒性大的药物，机械通气时注意避免气压伤及肺部感染，控制输用库存陈旧血，因为库存6天以上的血含有大量微粒，包括已凝集变性的血小板、细胞碎屑、纤维蛋白及其他纤维蛋白沉淀物等，它们可引起微血栓及其他并发症。
9.抗炎症介质治疗 MODS已被认为是一种“介质病”(Mediators disease)，在于机体过度释放众多炎症介质所引起的炎症反应失控时;激发的连锁反应导致远距离器官功能障碍或衰竭，以及在某些情况下，单纯抗生素治疗或外科手术引流可能无济于事。介质疗法就是针对潜在的启动因子、全身性介质、增效因子和损伤效应器的可能治疗方法。
(1)抗内毒素治疗：抗内毒素单克隆抗体制剂，E5和HA-1A。E5是直接针对脂多糖类脂A(Lipid A)IgA抗体，它可以同各种与临床有关的革兰阴性菌的脂多糖结合。HA-1A是一种内毒素核心糖脂的人单克隆抗体。试验证明，HA-1A能使革兰阴性菌血症患者的病死率从40%下降至30%，目前虽均在动物试验阶段，但显示出良好前景。
(2)抗细胞因子疗法：抗细胞因子有两种对策，一是抑制或减少细胞因子的合成或释放;二是削弱或阻断细胞因子的作用。细胞内cAMP水平的增加可能通过某种未知机制阻断TNF基因的转录活性，从而降低LPS刺激后TNF mRNA的扩增。己酮可可碱(Pentoxifylline)通过增加细胞内cAMP的浓度可明显减少TNF产生。氨力农(氨吡酮)是一种磷酸二酯酶Ⅲ的选择性抑制剂，能增加细胞内cAMP的浓度，阻断TNF产生，甚至比己酮可可碱作用更强。某些β受体激动药包括多巴酚丁胺也可通过增加细胞内cAMP浓度减少TNF的产生。皮质类固醇通过减少TNF mRNA的翻译活性能减少TNF对刺激的反应性分泌。当巨噬细胞受内毒素刺激后，即给予地塞米松，可明显抑制TNF的基因转录、TNF mRNA翻译阻止TNF的合成。然而大剂量应用虽可阻止TNF合成，但却能引起持久的非特异性的免疫抑制。而且，当mRNA翻译已经开始进行，糖皮质激素则不起作用，这一结果可以解释临床上在败血症已经进展的情况下使用糖皮质激素作用甚差的原因之一。
为了阻断或削弱细胞因子，目前用3类药物：
①抗体，包括细胞因子抗体或抗受体抗体，可影响细胞因子的释放，例如抗肿瘤坏死因子抗体(Anti-TNF)、受体抗体(Anti-LIIR)、抗白介素-1抗体(Anti-IL-1)等。
②抑制物，即受体的细胞外片段脱落，进入血液循环后与相应细胞因子结合，阻止生物效应的产生。例如可溶性肿瘤坏死因子受体(sTNFR)、可溶性白介素-1受体抗体(sIL-1Rs)等。
③受体拮抗物，即某些类细胞因子分子与相应的受体结合，使信息的转录机制无法启动。例如，白介素-1受体拮抗药(IL-1Rα)、血小板活化因子受体拮抗药(PAFα)等。目前世界范围内正在就不同细胞因子的抗体进行前瞻性随机对照的临床试验研究。其中作用明确、疗效肯定的有TNF-α单克隆抗体(TNF-Mab)，IL-1受体拮抗药(IL-1Rα)和PAF受体拮抗药(PAFα)，分别已进入Ⅰ～Ⅲ期临床试验阶段。
10.中医中药防治MODS 中医应用清热解毒、通里攻下、活血化瘀等治疗法则，通过清除内毒素、保护肠道屏障、拮抗炎症细胞因子、提高机体免疫力、增加器官功能储备等途径，起到“菌毒并治”、“釜底抽薪”的功效，进而防治MODS。