由于MODS及MOF的发病机制十分复杂，因而临床表现多样，为便于观察，目前将临床上的表现一般可以分为下列四期，但是临床的过程也并非能如此清楚地分开。
1.第一期 此期患者临床表现隐匿，外表似乎正常或基础病未加重，但可有气急及呼吸性碱中毒，回心血量轻度增加和肾功能有早期改变。一般第一期患者体格检查时可能正常，然而详细检查发现，他们的血液需求量稍高，肾功能可能异常，所有其他器官的功能也可能异常。一般出现在休克与创伤后，经过复苏，呼吸在25～30次/min以上，出现氧缺乏。这是肺功能不全的早期表现，开始时X片上很少观察到有异常变化，无湿?音，可有粗糙鼾音，因缺氧而代偿性过度通气产生呼吸性碱中毒，PaCO2下降。
2.第二期 患者经过早期复苏之后，循环稳定，肾功能正常，术后12h或更长一些时间，患者进入第二期后，出现病态，轻度病容或基础病加重，血流动力学可为高排低阻型，呼吸急促，缺氧明显，有呼吸性碱中毒、氮质血症，可出现黄疸和血小板数下降。临床上详细观察各种器官系统表明每一系统都有轻度的功能异常，这些异常可较容易检出。出现呼吸窘迫，频率加快，PaO2明显降低，肺底部出现湿?音，X片显示肺纹理加重。此时虽提高氧的吸入，PaO2仍不能提高到相应的水平。
3.第三期 进入第三期后，任何人都可发现患者患病。遗憾的是，上述许多患者的治疗均在此阶段开始，每个器官系统都有明显的临床异常表现，有明显的MOF表现，病情危重、休克、心排血量减少、水肿、严重缺氧和氮质血症，出现代谢性酸中毒和高血糖，血液系统出现凝血异常。呼吸进行性困难，出现青紫，两肺?音增多，胸片出现两肺弥散性团块阴影到肺实变，虽然给以高浓度O2吸人，但是因肺内分流增加而PaO2仍不能升高，PaCO2开始上升，此阶段患者必须用机械通气。
4.第四期 第四期患者已处于濒死状态，心脏负荷增加，呼吸不规则甚至暂停，少尿，重度酸中毒，氧耗增加，可出现肝性脑病和昏迷。此期多伴有多器官之衰竭，循环系统衰竭，心律失常，最终死于一个或多个维持生命器官系统的衰竭。
1.MODS诊断要点必须强调以下几点：
(1)发生MODS要有两个基本条件，一是机体遭受到严重打击，二是采用了20世纪70年代以来的现代治疗措施，包括复苏、生命支持和抗感染等，这些积极措施使许多患者经受住了严重创伤、休克或感染的早期打击，却往往难以摆脱随之而来的种种并发症，出现“失控的全身炎性反应综合征”，以至器官功能受损，进行性的MODS发展为MOF。
(2)与严重创伤、休克和感染及大手术后关系十分密切。但休克本身并不是MODS。
(3)高分解代谢且外源性营养不能阻止自身消耗。
(4)高动力型循环，表现为高排低阻。
(5)病理学改变缺乏特异性，主要是广泛的炎性反应。
(6)一旦治愈可不遗留器官损伤的痕迹，也不转为慢性。
2.MOF诊断要点 MOF诊断要点必须强调以下几点：
(1)原发致伤因素必须是急性的，常见为严重创伤、休克、感染、大面积烧伤、急诊大手术等，而继发性损伤大都发生于远隔部位的组织器官。其来势凶猛，病死率很高。
(2)致病与发生MOF必须有一定的间隔时间(>24h)。
(3)患者在发生MOF之前，大多数器官功能是良好的。
(4)器官功能的损伤是可逆的，一旦病理生理机制被阻断，器官功能可望恢复。
(5)MOF与一些慢性疾病的终末期，肝肾综合征、肺脑综合征、心力衰竭合并肝、肾功能衰竭，癌症晚期合并脏器功能衰竭是完全两种不同的概念。
(6)若在发病24h之内死亡，属于复苏失败之列，不属于MOF范围。