子宫输卵管造影术是检查输卵管堵塞的最可靠方法之一，准确率可达95%以上。但由于X线照射的影响及技术操作不规范造成诊断失误及错误等，也会造成一些并发症。
1.输卵管穿孔
输卵管穿孔多发生于输卵管内膜病变严重，粘连紧密的情况下，穿孔率为3%左右，一般由于穿孔直径甚小，多为0.038cm的导丝所致，一般无明显的临床症状，无需特别处理。
2.输卵管妊娠
除输卵管近端梗阻外，其远端亦有病变，输卵管再通术后宫外孕的发生率约为5%～13%，病变均在壶腹部，远离再通部位。对再通术的妊娠应予以密切监测，早期诊断宫外孕，以采取有效的保守治疗。
3.再次梗阻
妊娠多发生于术后第6～12月，若1年仍未怀孕，50%应考虑再次梗阻，梗阻的原因可能是输卵管内重新出现了与前类似的病变。
另外，普通的子宫输卵管造影检查时，病人所接受的放射剂量经阴道测量为对患者的生育功能和胎儿的正常发育可能也会造成影响，输卵管堵塞患者进行手术之后若半年未能妊娠，还应考虑是否存在盆腔病变，应及时行腹腔镜检查。