儿童肥胖症可通过饮食疗法，运动疗法及药物治疗来治疗。具体疗法的选择，可根据儿童肥胖的程度来决定。
1.饮食疗法
儿童肥胖症应注意饮食调理，平时应以低脂肪、低糖类和高蛋白饮食为主。低脂饮食可让机体消耗自身的脂肪储备，从而慢慢达到减重的效果。建议儿童肥胖症患者平时可多吃一些体积大而热能低的蔬菜类食品。
2.运动疗法
运动对身心健康都有利，尤其对于肥胖的儿童，还有减重的效果。因适当的运动可以促使脂肪分解，减少胰岛素分泌，从而让脂肪合成减少，蛋白质合成增加，有利于促进肌肉发育。对肥胖儿童不喜欢运动的，可鼓励和选择一些易于坚持的运动，如晨间跑步、散步、做操等，每天要坚持半小时。注意运动要循序渐进，不宜急于求成，否则运动量过大也可引发不良后果。
3.药物治疗
如果儿童肥胖症伴有高胰岛素血症的，可采用双胍类、噻唑烷二酮类药物来治疗，如可选择二甲双胍片、吡格列酮片、罗格列酮片等药物。
儿童肥胖症在治疗的同时，一定要注意养成良好的的生活饮食习惯，忌暴饮暴食或是久坐不动，否则会导致体重进一步上升，从而引发各种并发症发生。