做深蹲膝盖疼有可能是髌骨关节炎，也有可能是其他原因。常见原因包括髌骨关节炎、半月板损伤、膝关节骨性关节炎、髌骨软化、膝盖滑膜炎等，应注意对症处理。
1.髌骨关节炎：髌骨关节炎是由于髌骨与股骨之间的髌骨关节出现了炎症而导致软骨的损伤，患者在深蹲时髌骨和股骨之间的软骨摩擦可引起疼痛。如果患者出现剧烈疼痛时，可遵医嘱服用非甾体抗炎药治疗，如塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等，严重的可酌情手术处理。
2.半月板损伤：当半月板后角出现了撕裂时，在深蹲时会挤压半月板的后角而致膝盖疼痛。如膝盖半月板损伤不是特别严重，没出现明显结构改变时，可选择药物治疗，可遵医嘱服用营养关节软骨的药物，如硫酸软骨素、盐酸氨基葡萄糖胶囊等，以促进半月板的恢复。严重的可考虑手术治疗，如半月板缝合术或者半月板切除术等。
3.膝关节骨性关节炎：膝关节骨性关节炎累及了周围的软组织以及有软骨损伤时时，会出现深蹲时膝盖疼现象。可进行膝关节的X线片、CT检查进行诊断，然后配合药物治疗，如可遵医嘱口服氨基葡萄糖、硫酸软骨素修复或保护关节软骨，或口服非甾体抗炎药或第二阶梯止痛药如氨酚羟考酮片等止痛。
4.髌骨软化：髌骨软化是由于髌骨下端软骨受到损伤或者缺血缺氧等原因导致的，如过度深蹲可能会加重髌骨软化症状而致膝盖疼痛和不适。建议平时要避免剧烈活动，可遵医嘱采用非甾体抗炎药，氨基葡萄糖，关节内注射透明质酸钠治疗。
5.膝盖滑膜炎：滑膜炎会导致局部的膝关节水肿，并出现疼痛，可以口服对症药物治疗。如保守治疗无效时，可手术治疗，切除滑膜，还可进行关节功能锻炼，使关节液得到充分的吸收。
平时患者应注意做好防护工作，要减少膝关节负荷或限制膝关节活动，尽量避免大量运动。同时要注意饮食调理，多吃豆制品、海带、猪蹄、新鲜果蔬等食物，补充蛋白质、胶原蛋白、钙质等，以防止骨质疏松。