在诊断中早期局限的病变应与乳头状瘤、湿疣、血栓外痔、肛裂及肉芽肿性溃疡区别诊断：
乳沟状瘤：肿瘤可带蒂呈葡萄状或者菜花状。如肿瘤较大，因反复摩擦，表面可溃破、出血和感染。病变生长缓慢，可无症状，通过病理检查可以鉴别。
湿疣：患者多有不洁性生活史或配偶感染史，醋酸白试验阳性，活体检测可见类似糜烂图样，中间鲜红至褐色，四周色泽逐渐减淡。
血栓外痔：多在排便或剧烈活动后，肛门突出肿块，疼痛剧烈，活动受限。肿块呈暗紫色，圆形或椭圆形，大小不等，稍硬，触痛明显。肿块过大，可致肛门皮肤缺血性坏死，也可溃破，自行排出，伤口自愈或形成肛瘘。
肛瘘：肛瘘临床上多见，一般以肛旁脓肿开始，局部疼痛明显，脓肿破溃后形成瘘，疼痛亦随之减轻。肛瘘多数在肛管后正中处，并与齿状线相连，肛管黏膜完整。有时形成硬结或条索状。指检时挤压可见瘘口流出脓性分泌物，往往在坐浴和抗感染后症状好转。肛瘘用探针检查即可证实，如疑有癌变，则应活检明确诊断。
肛周皮肤癌： 肛周皮肤癌常伴肛门不适、明显瘙痒、肛门缘有小肿物并逐渐增大，生长缓慢、疼痛较轻，形成溃疡后有腥臭分泌物，边缘隆起外翻。活检为分化较好的鳞状细胞癌，角化多，恶性度低，不易发生转移，放射治疗效果良好。检查时只要细心观察，可见肿瘤中心点是在肛门缘以下。尽管已发生溃疡，腹股沟淋巴结转移也不多。
患者在治疗期间要与其建立良好的护患关系，重视语言交流。护士的态度要和蔼，举止文雅;对病人要在治疗和精神上给予关心，要耐心、细心，要有爱心护士要经常接近病人，明确回答病人提出的问题，切不可说出消极的语言而加重病人的心理负担。要帮助病人解决实际困难，用自己娴熟的技术取得病人的依赖，争取病人的配合。