肝内胆管小结石在临床上比较常见，其病因可能与胆道感染、高脂肪饮食等因素有关。目前肝内胆管结石的治疗存在诸多问题，如结石不能彻底清除，肝内胆管狭窄易引起胆汁引流及结石复发等。当前治疗肝内胆管结石的方法，主要是以手术治疗为主的综合治疗。
1.手术治疗：目的是尽可能的清除结石，解除胆道阻塞及狭窄，排除肝脏感染性病变，使胆汁排出畅通。其主要手术方法为高位胆管切开取石术、胆肠引流、清除肝内感染性病变等。
2.中医治疗：除了手术等综合治疗外，患者还可以配合针灸，还可以服用消炎利胆中药，以控制炎症，促进结石的排泄。
3.残余结石的处理：术后 T管造影发现胆管内残留结石时，可将T管插入窦腔后，用纤维胆道镜插入窦腔，用石钳、网篮等将结石取出，直视下。若结石太大，可采用激光碎石术、微量爆破或其他方法将残余结石破碎成小块。
4.溶石治疗：以溶石治疗胆固醇结石(MTBE)为胆固醇结石的体外溶石试验，其溶解胆固醇结石的能力是辛酸甘油酯的50倍，国内外有临床试验报道。在临床上，辛酸甘油酯的溶石周期为10~14天，而 MTBE仅需4~4.5 h，对 MTBE具有较强的毒性。
5.饮食治疗：胆管结石患者的食谱应该遵循高糖、高蛋白、高纤维素、低脂肪的原则，多吃鱼、鸡蛋、瘦肉及新鲜蔬菜、水果等，少吃淀粉(米、面)主食。如有需要，病人也可以在医生指导下，服用具有利胆祛湿作用的中成药。
总之，对于肝内胆管小结石，目前有手术治疗、中医治疗、残存结石治疗、溶石治疗和食物疗法。一般说来，大部分肝内胆管小结石患者没有明显的临床症状，在遇到诸如寒冷、劳累、饮食不当等不良刺激时，也会出现相应的症状，而一旦出现这种情况需要及时就医。