目前HGV感染的实验室诊断主要是运用反转录聚合酶链反应法(RT-PCR)，来检测血清中HGV RNA以及用酶联免疫试验(EIA)检测血清中抗-HGV抗体。人或动物感染庚型肝炎病毒后约1周左右，血清中可检测到HGV RNA，一般于感染3周才出现抗-HGV抗体阳性。因此，RT-PCR法可作为庚型肝炎病毒感染的早期诊断。国外报道EIA法与RT-PCR法的阳性符合率仅为3%～18%，不宜作为HGV感染的实验室诊断。但最近我国自行研制的抗-HGV EIA法与RT-PCR法的阳性符合率可高达60%，可望用于HGV感染的筛查。