做胎儿亲子鉴定主要为3个步骤，即采集嫌疑父亲检材、采集羊水、样本送检。
1.采集嫌疑父亲检材：胎儿亲子鉴定是指利用基因技术鉴定胎儿遗传意义上的父亲。第一步为采集嫌疑父亲检材，若不希望嫌疑父亲知道，孕妇可以提取下列任何一种检材即可进行鉴定：嫌疑父亲的血痕(用过的创口贴)、抽过的烟头、毛发(需拔下带毛根)、指甲、精斑、嚼过的口香糖渣、牙签、内衣、内裤、牙刷、酒杯等。
2.采集羊水：孕妇妊娠16周后，可以进行羊水穿刺，采集羊水，做羊水DNA亲子鉴定。
3.样本送检：可以采用匿名亲子鉴定方法，不用提供本人姓名及个人资料。
胎儿亲子鉴定是一种“三联体”鉴定，即父亲、母亲加腹中胎儿的DNA鉴定，胎儿亲子鉴定的手续并不繁琐，其鉴定的安全性、准确性是有保障的。无论结果如何，都应对胎儿负责。