紧急避孕药物对卵巢功能和子宫内膜的影响仅是一次性的，不会影响今后的生育能力。紧急避孕药物的副作用包括恶心、呕吐、阴道少量出血、下次月经提前或延后、以及头晕头痛、乳房胀痛等。这些症状一般比较轻微，不会影响身体健康。但是短时期内多次服用紧急避孕药，会增加药物副作用，它不能作为常规的避孕方法使用，更不能作为流产药物服用。
目前，尚无明确的资料可表明紧急避孕药物与宫外孕有密切关系。通常紧急避孕药物不会增加宫外孕的发生率。但是，如果当月经延迟1周以上时，就应到医院检查，以排除怀孕或宫外孕的可能。
紧急避孕药物是否有效？
“我使用了紧急避孕药，为什么还是怀孕了？”
的确，紧急避孕药没有常规的其他事前服用的避孕药物疗效显著。但是，如能正确使用，在不安全的房事后还是很有效的，它的失败率约为1%～2%。
紧急避孕药什么时候吃？
左炔诺孕酮在没有保护的房事后72小时之内口服2片，可以一次性服用，也可以间隔12小时分两次服用。米非司酮在没有保护房事后120小时之内口服1片。
在一个月经周期内不能有2次以上的无保护房事，也就是说紧急避孕药物只能对前一次不安全的房事作保护，而且在一个月经周期内不应该多次服用紧急避孕药，其疗效会有所下降。如服药后1小时内发生呕吐，应尽快补服一次。在性生活后服药越早服越有效！
紧急避孕药的副作用有哪些？
紧急避孕有其独特的优点，也存在一些可能发生的副作用。了解这些副作用，在使用中加以注意和预防，可以充分发挥紧急避孕的作用，将其可能的副作用降至最低限度。使用紧急避孕药物后可能发生下面这些副作用：
(1)恶心：不同的药物发生率不同，其中米非司酮最低，为6%—7%。恶心一般持续不超过24小时。
(2)呕吐：不同的药物发生率不同，左炔诺孕酮约5%，米非司酮约1%。通常认为，与食物同时服用或睡觉前服药可以减少恶心、呕吐的发生率，但无确切的临床资料。
(3)不规则子宫出血：有些妇女用药后会有阴道点滴出血，一般无需处理。
(4)月经改变：多数妇女月经会按时来潮，也有一部分妇女月经提前或延迟。如果月经延迟1周，应该做尿妊娠试验，以明确是否是紧急避孕失败。
(5)其他：乳房胀痛、头痛、头晕、乏力等，这些症状一般较轻微，持续时间不超过24小时。乳房胀痛、头痛严重者可用阿司匹林或其他止痛药对症处理。