由于角膜基质炎在临床上的病例少，导致很多医生都没有见过此病，即使确诊疾病了也会怀疑误诊。并且生活中还有一些疾病与角膜基质炎有类似的症状，在诊断疾病的时候，一定要仔细鉴别，那么角膜基质炎需与哪些疾病相鉴别呢?需鉴别的疾病如下：
1.急性梅毒性角膜基质炎
是先天性梅毒的晚期表现之一，大多数发生于5～20岁，但也可以早到出生时，晚至50岁，梅毒血清学检查阳性，眼部征象包括“胡椒盐”状的脉络膜视网膜炎或视神经萎缩等，同时伴有其他先天性梅毒的晚期症状，均提示本病的存在，一些其他的晚期梅毒表现，包括Hutchinson牙齿和骨骼的畸形，第Ⅷ对脑神经受累导致耳聋，精神发育迟缓及行为异常等。
性病史，中枢神经系统症状或心血管受累，加上梅毒血清学检查阳性，即可确诊后天性梅毒。
2.结核性角膜基质炎
取决于眼部所见，梅毒血清学检查结果阴性，结核菌素试验阳性以及全身性结核感染的病史。
3.麻风性角膜基质炎
面部有典型的“狮样面容”，眼睑皮肤增厚，秃睫，面神经麻痹是常见的晚期征象，可形成兔眼和睑外翻，角膜神经可发生节段性的增粗，形成“串珠”状，虹膜表面可以出现小砂石状的乳白色结节，在睑裂处角巩膜缘的巩膜侧有黄色胶样结节以及角膜颞侧浅层血管翳等可确定诊断。
温馨提醒：需与角膜基质炎相鉴别的疾病就是以上这些，在诊断的时候要引起重视。一旦确诊疾病，要进行相应的治疗，避免疾病更严重，扩散到全身。并且在治疗的时候，要随时观察眼睛，避免疾病发生并发症，发生更严重的疾病，如视神经萎缩，耳聋等。