掌握住精神发育迟滞特征及诊断要点，则鉴别诊断并不困难。但要注意在以其他精神病症状为主的病人中，不要忽视精神发育迟滞的症状。
1.暂时性发育延缓 各种心理或躯体因素，如营养不良、慢性躯体疾病、学习条件不良或缺乏，视觉、听觉障碍等都可能影响儿童心理，包括智力的正常发育。但这些原因去除或纠正以后，心理发育速度可在短期内加速，赶上同龄儿童的智力水平。
2.特定性发育障碍 特定性言语和语言、学校技能或运动技能发育障碍都可能影响儿童在学习和日常生活中智力水平的发挥，表现为学习困难、人际交往困难和社会适应能力下降。但通过对儿童发育水平的全面评估可发现这些患者除了特定的发育障碍以外，其他心理发育完全正常，在不涉及这些特定技能的时候，可以完成学习任务。而精神发育迟滞患者在任何情况下，智力水平和学习成绩都是一致的。
3.儿童精神分裂症 精神症状会影响患者正常的学习、生活、人际交往等社会功能。但精神分裂症患者病前智力正常，有起病、症状持续及演变等疾病过程，有确切精神病性症状，根据这些特点可与精神发育迟滞相鉴别。
4.注意缺陷与多动障碍 可有注意力不集中、不守纪律、学习成绩差、社会适应能力差等，类似精神发育迟滞，但其智力经检查在正常范围内，在督促下成绩可明显提高，服药治疗有显著效果，可与精神发育迟滞鉴别。
5.儿童孤独症 除智力障碍以外，还有与智力发育水平不相当的突出的语言发育问题，明显的社会交往问题。孤独症儿童智力的各方面发展不平衡，精神发育迟滞则是智力全面发育低下，智力测验各分量表得分都是普遍性低下。