本病应与下列各种病变鉴别：
1.宫外孕有月经延迟、急性腹痛及阴道流血。子宫直肠窝触痛更多发生于宫外孕及盆腔子宫内膜异位症。β-HCG定量试验达到一定浓度就可明确诊断。虽然约有20%的扭转病人同时有宫内妊娠，依靠B超扫描显示宫内胚囊就可鉴别附件扭转合并宫内妊娠与宫外孕。
2.急性盆腔炎(PID)腹痛、触痛一般多为双侧性。急性扭转的腹痛发作较PID更为突然和剧烈。PID可触及双侧炎性肿块，而急性扭转的肿块一般为单侧，且更呈球状。PID还具有相关病史：如有PID发作史，性生活紊乱，性伴侣有冶游史，或最近有放置宫内节育器等宫内手术操作，均可协助诊断。
3.阑尾炎腹痛一般从上腹部转移到右下腹部。肛诊：附件区无触痛，盆腔无异常发现;附件扭转者腹痛急骤，发作时即伴有恶心呕吐，而阑尾炎出现的恶心呕吐随病情进展而逐渐发生，凡主诉右下腹痛而剖腹手术不能明确诊断阑尾炎者，均应探查盆腔脏器有无异常。
4.附件包块没有发生扭转的附件包块一般不引起疼痛，除非包块破裂、扭转或内出血。
5.卵巢卵泡或黄体破裂症状不如扭转那样严重，如不再出血，症状可在1～2天内消失。发作时间与月经周期有关，常在月经中期或月经前几天，很少出现恶心呕吐。症状严重和持续者盆腔检查时有子宫直肠窝饱满和触痛等体征。
6.肾结石腹痛呈剧烈阵发性疼痛，向大阴唇放射，但以季肋部、肋脊角或背部叩击痛显著，伴有血尿。无腹肌痉挛，无附件包块触及。有反复发作的既往病史。静脉肾盂造影可明确诊断。
7.子宫肌瘤急性变性较罕见，腹痛较剧，伴有发热，带蒂的浆膜下肌瘤容易与本病混淆，通过腹腔镜或B超检查能明确鉴别。所幸异病同治，误诊手术对患者丝毫不受影响。