1.EKC 潜伏期5～12天，多为8天。常双眼发病，开始为单眼，2～7天后另眼受累，患者有异物感、烧灼感，怕光、流泪及轻度视力障碍。
(1)全身表现：有发热、咽痛、腹泻、上呼吸道感染、肺炎等。此种情况多见于儿童，成年人则较少有全身症状。多见有耳前、颌下淋巴结肿大并压痛。
(2)结膜病变：有大量滤泡形成，以上、下穹隆部最多。结膜充血、水肿明显，下睑结膜有假膜形成。水样分泌物。上睑结膜有点状出血。有时睑结膜可出现扁平瘢痕或睑球粘连。
(3)角膜病变：
①周边部表层点状角膜炎：结膜炎发病后1天，部分患者角膜缘出现局限性充血，相应角膜周边部出现散在表层点状角膜炎。
②中央部表层点状角膜炎：发病1周左右，角膜中央部也出现表层点状角膜炎，裂隙灯下荧光素染色检查，点状病变微隆起于角膜表面，数量多少不等，有的呈散在分布、有的呈簇状排列。角膜知觉减退。
③上皮下浸润(subepithelial infiltration)：发病2～3周后，结膜炎及表层点状角膜炎的体征逐渐消失;另一种角膜病变上皮下浸润同时或相继出现，位于前弹力层和基质浅层之间的灰白色圆形或半圆形浸润病灶，直径为0.2～0.5mm(很少超过1mm以上)。数目不等，可数个到百余个，荧光素染色阴性，无新生血管生长。常历经数月、数年才可吸收，不形成溃疡。若发生于瞳孔区，可造成一定程度的视力损害。
④多发性角膜上皮糜烂：部分患者在2～3周结膜炎症消退后发生弥漫性上皮糜烂或丝状角膜病变。发病机制不清楚，可能与EKC的泪液分泌减少有关。此外Ad8、19型尚可引起轻度的前部葡萄膜炎。
2.PCF 潜伏期5～6天，常为双眼发病，可先后或同时发病。典型的表现为结膜炎、发热、咽炎三联征。
(1)结膜、角膜炎：急性滤泡性结膜炎是最突出的也是病程最长的临床表现，可见眼睑及结膜水肿，滤泡形成，下睑结膜较上睑结膜多。部分患儿角膜可出现细点状上皮浸润、卷丝，一般随结膜炎好转而痊愈，不留痕迹，也不发生上皮下浸润。
(2)发热：一般表现为骤起性高热，持续4～7天。发热程度与年龄有关，儿童体温升高较明显，常伴有畏寒，头痛，肌肉酸痛，腹泻等症状。
(3)咽炎：表现为咽痛及咽部充血，出现率不如结膜炎和发热高。
本病在流行期间不难诊断。该期内凡发现有球结膜充血及上眼睑肿胀的患者，都应首先考虑本病。其最终诊断还取决于病毒分离和血清学检查的结果。