慢性肠炎患者可以遵医嘱吃一些益生菌、氨基水杨酸制剂、糖皮质激素药物来进行治疗。同时在进行治疗的期间内，需要遵医嘱合理使用药物，积极配合医生进行治疗。
1.益生菌
益生菌能够纠正肠道菌群的失调，对慢性肠炎引起的腹泻是有一定疗效的。目前常用到的益生菌有双歧杆菌三联活菌胶囊、乳杆菌活菌胶囊、地衣芽孢杆菌活菌胶囊与蜡样芽孢杆菌活菌胶囊等。
2.氨基水杨酸制剂
常用药主要有美沙拉嗪肠溶片，对肠壁的炎症是具有很好的抑制作用的，同时患者也可以用柳氮磺吡啶肠溶片、奥沙拉嗪钠胶囊、巴柳氮钠片等药物进行治疗。
3.糖皮质激素
常用药物有泼尼松片、氢化可的松片或是地塞米松片，这类药物主要是用于水杨酸制剂治疗效果不佳的中重度患者。除此之外，对于症状反复及激素依赖的患者，还可使用免疫抑制剂来进行治疗。
慢性肠炎患者在生活中要遵医嘱合理使用药物，日常要养成良好的生活习惯和饮食方式，平时要以清淡易消化的食物为主，尽量少吃一些辛辣刺激性，以及油腻重口味的食物。此外，该患者日常还可加强运动锻炼，增强体质，提高机体的免疫力。