(一)发病原因
真正病因尚不十分明确。目前认为儿童尿道黏膜脱垂见于体弱的女孩，与骨盆快速增大、盆腔器官发生变化有关，加之尿生殖膈薄弱、尿道黏膜与黏膜下黏合的先天性缺损，易发生黏膜脱垂。老年妇女脱垂可能是由于分娩损伤、绝经后雌激素水平降低，尿道周围组织萎缩、或全身衰弱等所致的尿道壁薄弱、尿道周围组织松弛以致尿道黏膜翻出。另外各种原因如剧烈咳嗽、便秘、腹泻、分娩、尿路感染、负重等使膀胱压力过高，造成膀胱尿道压力不平衡，加之尿道周围支持组织力量不足，也可导致本病的发生。其他如膀胱结石、尿道结石或肿瘤的直接压迫也可诱发。
(二)发病机制
女性尿道垂直向下，短而宽，若肌层弹力纤维较薄弱，周围组织松弛，黏膜发育超过肌层，尿道黏膜尤其后壁便向下翻出尿道外，形成部分性尿道黏膜脱垂。如尿道壁也松弛，则整个尿道黏膜脱出形成完全性尿道黏膜脱垂。脱垂黏膜因受尿道口环形压迫、衣物摩擦刺激等充血水肿，甚至血管栓塞及坏死，亦可继发感染、糜烂等。