(一)治疗
本病过去以磺胺药治疗为主。20世纪60年代起，脑膜炎球菌先是B群，继而A群和C群，均有耐磺胺菌株引起流行的报道，且耐药率不断增高。在欧洲有48.3%的Nm对磺胺类药物耐药，其中罗马尼亚、西班牙和法国等有70%以上的菌株对磺胺类药物耐药。在欧洲对青霉素和利福平耐药的菌株不多，分别占0.8%和0.2%。我国监测的结果也是对磺胺类药物耐药的菌株较多;10%～29.8%的菌株对磺胺甲?唑耐药，个别地区高达50%。其次是对乙酰螺旋霉素耐药的菌株占22.9%。未发现对氯霉素耐药的菌株，对青霉素耐药的菌株也少见，故对脑膜炎球菌感染，应以青霉素为首选。
1.普通型的治疗
(1)一般疗法：病室力求安静，空气流通。饮食以流质为宜，并给予适当的液体输入，急性期早期液体量应限制在1200～1500ml/d。必要时可鼻管饲食。密切观察病情变化。神志不清者应加强护理，如保护角膜以防溃疡形成，保持皮肤清洁及经常改换体位及拍背以防止褥疮和呼吸道感染。呕吐时防止吸入。惊厥时防止舌咬伤。呼吸困难时给氧。
(2)病原治疗
①青霉素：青霉素在脑脊液中的浓度一般为血浓度的10%～30%，注射普通剂量不能使脑脊液内含量达到有效杀菌浓度，但注射大剂量能使脑脊液内药物达到有效浓度，治疗效果满意。青霉素的剂量成人为20万～30万U/(kg·d)，儿童为10万～25万U/(kg·d)。应将分次剂量每2～3h推注(青霉素G)或快速静脉滴注。如以青霉素缓慢静脉滴注，则其峰浓度较间歇快速注射者为低，故不宜缓慢滴注。如诊断确定，则不需加用其他抗生素，单用青霉素已足够控制感染。
青霉素鞘内注射可能招致发热、惊厥、蛛网膜下腔粘连阻塞、脊髓炎及下肢疼痛等严重反应，故不应采用。
脑膜炎球菌一般对青霉素保持高度敏感，最低抑菌浓度<0.03mg/L。但近数年来，B群和C群脑膜炎球菌开始对青霉素产生低水平耐药，最低抑菌浓度在0.25～1.0mg/L之间。这是由于青霉素结合蛋白-2发生了结构改变，使青霉素的靶位亲和力降低，这种相对耐药性的产生尚不致影响大剂量青霉素的疗效，但值得注意今后脑膜炎球菌的耐药动态变化。
②氯霉素：氯霉素较易透过血脑屏障到达脑脊液中，为血浓度的30%～50%，且脑膜炎球菌对之亦很敏感，因此当患者对青霉素过敏时，可改用氯霉素治疗。剂量成人为50～100mg/(kg·d)，儿童为50～75mg/(kg·d)，根据病情分次口服、肌内注射或静脉滴注。使用氯霉素时，应严密注意其副作用，尤其是对骨髓的抑制。在越南和法国已分离出对氯霉素高度耐药菌株(MIC>64mg/L)，这些耐药株均为B群，其耐药基因与转座子Tn4451部分插入序列高度同源，转座子Tn4451携带有catP基因。
③氨苄西林：成人剂量为12g/d，每2～3h分次快速静脉滴注。本品对流感杆菌和肺炎球菌所致脑膜炎亦有效。
④头孢菌素类：第一代头孢菌素因不易透过血脑屏障，故不宜应用。第三代头孢菌素研究应用较多者为头孢噻肟和头孢曲松，疗效良好。这类药物毒性低，抗菌谱广，对β内酰胺酶稳定，且脑脊液内浓度较高，故对病原诊断尚不明确者可以应用。头孢噻肟成人剂量为4～6g/d，儿童剂量为150mg/(kg·d)，分四次静脉快速滴注。头孢曲松成人剂量为2～4g/d，儿童为100mg/(kg·d)，1次/d静脉滴注。
⑤磺胺药：在耐磺胺率低于10%的地区仍可应用。成人采用磺胺甲?唑/甲氧苄啶(复方磺胺甲基异?唑)片或针剂(含磺胺甲?唑0.4g，甲氧苄啶0.08g)，3片/次或3支/次，2次/d。儿童按磺胺甲?唑(磺胺甲基异?唑)50～80mg/(kg·d)计算，分2次口服、肌内或静脉注射。亦可采用磺胺嘧啶加甲氧苄啶治疗。有肝、肾疾病，对磺胺药过敏或有毒性反应者均不宜应用。磺胺耐药的机制是由于Nm染色体上编码二氢核黄素的基因突变所致。
以上各种抗菌剂的疗程均为5～7天。
(3)对症治疗：头痛可酌用可待因、阿司匹林，或用高渗葡萄糖注射液静脉注射。高热时可用乙醇擦浴;或小剂量安乃近肌内注射。惊厥时可用副醛0.2mL/kg肌内注射，或用10%水合氯醛灌肠，成人5～15ml/次，儿童每次20～30mg/kg。镇静剂剂量不宜过大，以免影响病情变化的观察。
(4)抗内毒素治疗：内毒素是本病主要的致病因子，清除或使内毒素失活可能减轻症状。常用的方法有血液滤过、特异性抗内毒素抗体(J5，HA-1A，BPI，rBPI21等)，但使用这些治疗后，病死率无显著下降。
2.暴发休克型的治疗
(1)抗菌治疗：以青霉素治疗，剂量20万～40万U/(kg·d)，用法同前。
(2)抗休克治疗
①扩充血容量：可采用生理盐水、平衡盐液、葡萄糖注射液、右旋糖酐40或血浆等快速输入，并根据中心静脉压、肺动脉楔嵌压、休克纠正程度、尿量等调节液体量和速度。一般休克纠正前输液需要量较大，速度亦较快。待休克纠正后立即减少，以免引起肺水肿。
②纠正酸中毒：应根据血二氧化碳结合力、pH值等补充碱性溶液如碳酸氢钠。
③给氧：充分供氧对休克患者十分重要。可经鼻导管或面罩输予。必要时应插入气管导管并以呼吸器辅助呼吸，使动脉氧分压维持在10.7～16.0kPa(80～120mmHg)。
④选用血管活性药物：在经过上述处理后，如休克仍未纠正，可应用血管活性药物。一般首先选用多巴胺，剂量为2～6μg/(kg·min)，根据治疗反应调整速度和浓度。本药可扩张内脏血管，增强心肌收缩力，但不致引起心律失常等副作用。如休克仍未纠正，且中心静脉压反有升高，或肺底出现?音等淤血体征时，可考虑应用酚妥拉明(苄胺唑啉)治疗。此药为α受体阻滞剂，可扩张全身小血管，改善微循环，尤其是体循环张力降低后，肺内血液可大量向体循环转移，从而解除肺部淤血和微动脉痉挛，防止休克肺的发生。此时中心静脉压可有所下降，肺内淤血解除，可以继续输液以纠正休克。剂量为5～10mg/L，静脉滴注，直至休克纠正。节后胆碱能阻滞剂，包括山莨菪碱、阿托品、东莨菪碱等亦可应用。山莨菪碱的副作用较阿托品小。剂量为每次0.3～0.5mg/kg，重症可用至1mg/kg，每15min静脉注射1次。有效时出现面色和指甲变红，四肢转暖，血压回升。此时可延长给药时间并逐渐停药。如应用8～10次后无效，则应改用其他血管活性药物。
⑤强心药物：流脑暴发休克型时，心肌炎并非少见。心肌收缩不良是引起休克的一个重要因素，故可适量给予去乙酰毛花苷(deslanoside)等快速洋地黄化制剂。
⑥肾上腺皮质激素：曾有研究显示大剂量皮质激素的应用认为对纠正休克有助;但也有相反的报道。氢化可的松剂量为300～500mg/d，静脉滴注。休克纠正后应迅速减量及停药，一般用药不超过2天。
⑦抗凝治疗：近年来对肝素治疗的效果评价不一。目前认为，除有实验室DIC的依据外，且有深部组织出血或血栓形成的表现时，才开始用肝素治疗。剂量为每次0.5～1mg/kg，加于10%葡萄糖注射液静脉滴注，并根据情况4～6h重复1次，多数用1次或2次。在开始应用肝素后，应给予新鲜血浆，以补充消耗的凝血因子。
3.暴发脑膜脑炎型的治疗 抗生素的应用如暴发休克型。治疗重点应为减轻脑水肿，防止脑疝和呼吸衰竭。
(1)脱水剂：20%甘露醇1～2g/(kg·次)，静脉推注或快速滴注，1次/4～6h，直至呼吸恢复正常，瞳孔两侧大小相等，血压恢复正常及其他颅内高压症状好转为止。甘露醇亦可和高渗葡萄糖交替应用，后者为50%溶液，40～60ml/次。肾上腺皮质激素亦可同时应用，以降低颅内压。
(2)亚冬眠疗法：主要用于高热及频繁惊厥以及有明显脑水肿和脑疝者。用法为氯丙嗪和异丙嗪各1～2mg/kg体重，肌内注射或静脉注射。安静后放冰袋于枕后、颈部、腋下及腹股沟，使体温迅速下降至36℃左右。第一次注射后，4～6h再肌内注射1次，共3次或4次。
(3)呼吸衰竭的处理：如出现呼吸衰竭的先兆，则除给予洛贝林或尼可刹米等中枢神经兴奋剂外，应立即作气管插管。插管后，尽量吸出痰液和分泌物，然后应用呼吸器辅助呼吸，并进行心肺监护。
4.慢性脑膜炎球菌败血症的治疗 抗菌药物的应用和普通型相同。
(二)预后
过去病死率在70%左右。在使用抗菌药物治疗以来，病死率降低至5%～15%，甚至低于5%。以下因素与预后有关：①暴发型的病程凶险，预后较差。②2岁以下婴幼儿及高龄患者预后较差。③在流行高峰时发病的预后较差，末期较佳。④有反复惊厥、持续昏迷者预后较差。⑤治疗较晚或治疗不彻底者预后不良，且易有并发症及后遗症发生。因脑膜炎球菌感染而病死者，大多数属暴发型。自应用血管活性药物如山莨菪碱等治疗，病死率有所下降。近年来对本病休克发病原理、DIC等认识加深，在治疗上采取抗菌药物、补充血容量，血管活性药物、强心剂以及重症监护等综合措施抢救，病死率进一步有所下降。应用抗菌药物治疗后，后遗症已较过去大为减少。失明、失听、智能减退，脑积水等都已少见，且多数发生于婴幼儿或高龄者而治疗不够及时。