皮脂腺囊肿和疖肿最明显的区别在于病因不同、皮肤表面的外观不同、患者的自身感受不同等。
1.病因不同：皮脂腺囊肿主要是由于皮脂腺排泄管受到阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。疖子主要是由于单个的毛囊及其周围组织的急性化脓性感染所引起的症状。
2.皮肤外观：皮脂腺囊肿患者可能出现皮肤凸起，也可能与皮肤相平，呈现肉色。但是在患处可以见到一个细小的开口连接，用手按压皮脂腺囊肿周围皮肤，可以从开口处挤出黄色或白色的皮脂，而且皮脂发酵后可能会伴随着恶臭。而疖肿主要是突起于皮肤的红色增生，面积一般为3-6厘米，可出现红肿情况，虽然疖肿中间可能也会有一些细小的开口，但开口内部一般不会因为挤压出现流出物，严重时可因化脓而形成脓液，并不是皮脂；
3.自身感受：大部分的皮脂腺囊肿不疼不痒，即使用手按压局部也不会出现明显的疼痛，只有合并细菌感染的时候，可能会出现轻度的疼痛感。而疖肿形成之后，患者会有明显的红肿和疼痛感，而且用手按压周围疼痛感会有明显地加剧；
除了上述区别外，还有其他区别，如治疗方法不同、实验室检查结果不同、解剖位置不同等。需要注意，这里只是对皮脂腺囊肿和疖子进行了一般性的描述，具体的诊断和治疗应该由医生进行评估，并根据个人情况进行处理。如果有类似的皮肤问题，建议咨询医生以获取准确的诊断和治疗建议。