青光眼睫状体炎综合征易被误诊为其他疾病，应主要与急性闭角型青光眼、Fuchs综合征和急性虹膜睫状体炎等相鉴别。
1.急性闭角型青光眼急性闭角型青光眼表现为眼压突然升高，患者有眼红、眼痛、头痛、视力下降、虹视、恶心、呕吐等明显症状，检查发现有睫状充血、角膜水肿、瞳孔轻度散大，呈竖椭圆形，前房浅，房角窄或关闭，不出现KP，这些特点有助于二者的鉴别。
2.Fuchs综合征Fuchs综合征虽然也典型地表现为单侧受累，不出现虹膜后粘连，易引起并发性白内障、眼压升高，但起病多隐匿或缓慢，眼压升高多为轻度～中度升高。其KP往往是星形，呈弥漫性分布、瞳孔区分布或下方三角形分布，虹膜有不同程度的脱色素，易出现Koeppe结节，也可出现轻度玻璃体混浊。根据这些特点，一般不难将二者鉴别开来。
3.特发性前葡萄膜炎特发性前葡萄膜炎分为急性和慢性两种类型，前者多起病突然，有明显的眼红、眼痛、畏光、流泪等症状，KP呈尘状，分布于角膜下方，有明显的前房闪辉和大量的前房炎症细胞，可出现虹膜后粘连，眼压一般不高或轻微下降，偶尔可出现眼压升高;后者起病缓慢，KP为尘状或羊脂状，位于下方角膜，前房闪辉和前房炎症细胞通常较为明显，易发生虹膜后粘连、虹膜周边前粘连、并发性白内障，眼压升高主要与房角炎症或闭塞、虹膜后粘连有关。根据这些临床特点，一般不难将特发性前葡萄膜炎和青光眼睫状体炎综合征鉴别开来。
4.新生血管性青光眼
5.炎症性开角型青光眼
6.其他如单纯疱疹病毒性或带状疱疹病毒性角膜葡萄膜炎。