尿石症必须与下列疾病进行鉴别：
1.急性阑尾炎 妊娠早期并发急性阑尾炎比较容易作出诊断。但在妊娠中、晚期急性阑尾炎症状与体征很不典型，易与尿石症引起的疼痛相混淆。通过严密观察病情的进展，连续做白细胞计数，进行尿路X线平片检查可资鉴别。
2.胆石症 胆结石引起的胆绞痛有时会与尿石引起的绞痛相混淆，但胆绞痛的发作大多在饱餐或进高脂肪餐后数小时内，或在腹部受到震动中发作;疼痛多在中上腹或右上腹，常放射至右肩胛处或右肩部，但要通过X线检查始能确定诊断。
3.胰腺炎 尿石症有时须与胰腺炎急性发作进行鉴别。急性胰腺炎最常见的症状为上腹部疼痛、恶心和呕吐，但急性胰腺炎常不易诊断，故对有急性上腹痛患者，均应考虑有急性胰腺炎的可能，早期多次测定血清或其他体液淀粉酶含量，对诊断有帮助，必要时行腹部X线平片检查可协助鉴别诊断。