随着现代医学的不断进步，始基囊肿的治疗已经有了针对性的治疗方法，在这样的方法中，我们还得注意抗真菌药物 ， 在抗真菌药物开发与应用的发展极为迅速，将这这些抗真菌药物于治疗当中，可以减少不良反应，不但原有抗真菌药物不断开发新的剂型以增加药物的生物利用度。以下介绍相关的始基囊肿治疗步骤和治疗方法。
对囊腔巨大、严重引起升支部畸形者，若非已发生病理性骨折需作截骨术，其余可考虑先由口内行囊肿开窗术，待囊液引流，囊腔减压，囊肿自行缩小后再行刮除术。行刮除术时多数行口外切口，于下颌体下缘1.5cm切开皮肤、皮下组织及颈阔肌，由颈深筋膜浅层向上分离，在咬肌前缘结扎并切断颌外动脉及面前静脉;
切断并掀起咬肌附丽暴露下颌角(注意易伤及面神经下颌缘支)及升支部外侧，去除囊肿表面骨外板，在直视下完整剥离囊肿，骨腔内放置引流条，分层缝合，轻加压包扎。
24～48h抽除引流条，5～7天拆线。 囊肿摘除术或囊肿刮除术。 囊肿摘除术，骨腔处理十分重要，对较小囊肿可任血液自然充满机化愈合。对较大囊肿刮除术后骨腔则需用碘仿纱条填塞骨腔，术后3天再逐步抽除。有学者采用自体髂骨骨松质充填骨腔;
也有人报道用经抗原处理后的异体骨充填骨腔，以诱导新骨形成。采用羟基磷灰石充填骨腔也可引导骨形成。经验认为，对于升支部骨质破坏极大有可能形成病理性骨折者，应采用下颌骨切除术，无感染情况可作游离骨移植;存在感染时可行二期植骨或血管化骨肌瓣立即移植术。
主要为手术治疗。由于始基囊肿有局部浸润周围骨质的特点，需将肿瘤周围的骨质至少在0.5cm处切除。否则，治疗不彻底将导致复发;而多次复发后又可能变为恶性。
对于始基囊肿的治疗是至关重要的，我们能想象到口腔是我们饿每天进食的部位，如果出现了问题，给我们的进食带来很大的困难，始基囊肿要早发现，及时治疗。以上的内容希望对大家来说有所帮助，对于治疗问题还是详细咨询有关方面的专科医生或专家，他们会做出更详细的解答，感谢大家对本站的支持和信任，谢谢!