如果输卵管积水量比较少，可保守治疗。治疗方法与慢性输卵管卵巢炎相同，采用四镜一丝联合复通术，输卵管积水红外线理疗结合中医的治疗方法，进行辨证治疗。不同的病因其治疗方式都是不一样，只有明确病因才能对症治疗。到正规专业的科技型不孕不育医院，在专业医生指导下针对性检查确定病因后对症治疗。
有时积水的输卵管与卵巢相粘连，并且与卵巢中的卵泡囊肿相互贯通，从而形成输卵管卵巢囊肿。若输卵管积水量较大，或已形成较大的输卵管卵巢囊肿，一般保守治疗效果不好，应考虑手术治疗。输卵管积水多为双侧性，与周围组织很少粘连。已经形成器质性病变用理疗是没有作用的，还是需要做手术，积极配合医生明确病因，对症治疗。可以做个腹腔镜下输卵管积水部分的反转缝合，术后效果会很好。
输卵管炎、输卵管积脓、或手术原因、长期输卵管结扎等都是导致输卵管积水的常见原因，需要进行介入治疗了。无论治疗什么病，都需要先查找其致病因素，针对性进行治疗。如患者没有经过专业医院进行系统的病因检测，就盲目用药物治疗的话，不但治不好病，还会产生抗药性，久而久之会对药物产生依赖性，最终导致迁延不愈。
目前输卵管堵塞的治疗方法很多，有输卵管通液治疗，经X线的输卵管介入疏通术治疗，宫腔镜、腹腔镜治疗，中药治疗，永磁旋振治疗仪，微波物理疗法治疗，以及一些其它的红外线，烤电，妇科治疗仪等，需要结合具体的检查结果，才能确定治疗方法， 可以说理疗对治疗的意义不大 。