输卵管囊肿通常是女性发现不孕时检查出来的，因为输卵管囊肿的症状与很多妇科病有相似症状，很容易混淆疾病，如阴道出血、下腹肿块、腹痛等，患者发现长期未避孕却一直不能怀孕的，或是身体有异常症状时要到医院检查，那么输卵管囊肿的检查方法有哪些呢?
1.通水(通液)检查：
输卵管通水是将一根管子与被检查者宫腔相连，然后通过管子注射药水20ml，药水一般是生理盐水加上抗生素。药水从子宫腔里流经输卵管，最后到达盆腔。在注水的过程中，如能顺利无阻力地推注入全部20ml溶液，放松针管后又无液体回流入针筒，提示溶液已通过子宫腔、输卵管腔进入腹腔中去，表明输卵管通畅;如阻力很大，放松针管后有10ml以上的溶液回流入针筒，表明输卵管阻塞不通;如虽有阻力，尚能注入大部液体，仅有少量回流，表明输卵管通而不畅。
2.输卵管造影检查：
经X线的子宫输卵管造影可以从荧光屏和X光照片上看到子宫腔的大小形态和位置、输卵管的形态。
通畅者，影像延伸到输卵管伞端口外，X光片上并可同时看到造影剂在盆腔的弥散。如有输卵管堵塞的症状，可明确显示输卵管堵塞部位、程度及性质。此方法还可辨认子宫内膜情况、输卵管和盆腔的结核病变情况，是目前诊断输卵管通畅性最可靠的方法。
3.腹腔镜检查：
通过子宫导管向子宫腔注入色素液如美蓝，经腹腔镜观察美蓝经输卵管伞端溢入盆腔，即为通畅;如有输卵管近端堵塞(输卵管间质部及峡部)，则见不到美兰液经输卵管伞端溢入腹腔;如为输卵管远端堵塞(输卵管壶腹部及伞部)则可见输卵管伞端增粗并蓝染，但没有美蓝流体流自输卵管伞端并流入腹腔，可认为输卵管堵塞。
输卵管囊肿的检查主要是这三项，检查后就能立即诊断疾病，患者可针对病情采取治疗，疾病的治疗主要是手术治疗，但是手术治疗对输卵管会有影响，因此也会影响将来的生育，如果患者是不孕做的检查治疗，就必须了解自然受孕的机率，如自然受孕机率低，可采取试管婴儿。