新生儿患肾囊肿初期一般没有特殊症状，一般新生儿会患肾囊肿的表现为新生儿出生时先天患有肾囊肿、后天肾脏的退化、受到刺激的放射导致发生变化，从而形成囊肿。当囊肿扩大压迫肾脏的时候，会产生疼痛感，有些病人会出现腰腹部不适、疼痛、血尿、腹部肿块、高血压、蛋白尿等，这是因为囊肿自身变大、囊内压力增高、感染等原因造成的。
1.新生儿出生时先天患有肾囊肿
肾囊肿属于一种肾病，其病因比较复杂，新生儿由于染色体隐性的遗传，并且新生儿的体质较弱。肾囊肿分为两种类型，一种是单纯的囊肿，数量很少，一般只有一两个，对肾功能不会造成损害。第二种是婴儿多囊肾，如果囊肿数量多，就会容易导致肾衰竭。
2.后天肾脏的退化
一般是由于新陈代谢失调，或者是随着某些疾病的逐渐加重有关，这种情况是需要用药来缓解。在治疗过程中要注意身体的变化，多喝温开水，以补充身体的水分，促进代谢产物的排出。
3.受到刺激的放射导致发生变化，从而形成囊肿
感染导致体内环境发生异常变化，从而产生有利于囊肿基因发生变化的环境条件，使囊肿的内部因素活性增强，这样便可促进囊肿的生成、长大，而身体任何部位的任何感染，又会通过血液进入肾脏从而影响囊肿，如囊肿发生感染，则除了使临床症状加剧外，还会促使囊肿进一步加快生长速度，并使肾功能损害加重等。
新生儿身体素质较差，对于肾囊肿情况首先考虑保守治疗，以免手术造成不好的影响，如果囊肿较大，并且对新生儿已经产生了不良影响，建议尽快去医院做具体检查，在医生的指导建议下进行针对性治疗。