胃肠道间质瘤来源于胃肠道间质，它不是癌症。癌症组织来源于上皮组织，并且是上皮组织导致的癌变，它们的来源并不相同，是两种不同的疾病。胃肠道间质瘤按其特征可分为极低危、低危、中危和高危四种，由于具有潜在的生物学恶性行为，所以容易复发且向远处转移。
胃肠道间质瘤早期没有明显症状，因此经常导致诊断和治疗的延误，约有三成左右的早期患者会以远处转移为首发症状。通常在胃肠镜检查中发现此病，而以下为胃肠道间质瘤的主要症状。
1.心脑血管系统症状：早期患者随着病情进展，除了会出现恶心或呕吐、呼吸受阻这类较轻微的症状，少数患者还会出现甲状腺功能减退和低血糖。
2.消化系统症状：当肿瘤侵袭部位达到消化系统时，会出现相应的症状。如食欲不振、上腹部疼痛、吞咽困难、腹部肿块等。除此之外，还会出现呕血或黑便症状，这是由于胃肠道间质瘤为柔软易碎的肿瘤，食物残渣经过时引起出血而导致。
3.异常疲劳感：大部分患者会出现症状，这是由于肿瘤缓慢出血而引起贫血引起的，少部分患者还会因此出现体重减轻。
4.肿瘤转移：肝转移和腹腔内种植播散是此病的常见转移，此时可引起皮肤蜡黄、尿液偏黄、厌食以及腹部不适等症状。
胃肠道间质瘤的位置和大小，以及转移情况会影响治疗和预后效果。因此，制定个性化的综合治疗方案会有效的提高治愈率，而目前胃肠道间质瘤最主要的治疗方法是手术治疗，其它还包括药物治疗和介入治疗。
胃肠道间质瘤即便无转移且进行彻底切除，大部分患者五年生存率仍然不足50%，并且还有复发的可能，已经发生转移的患者生存时间则更少。因此，对于40岁以上的人，建议每五年做一次胃肠镜，以便在早期发现肿瘤并进行根治，而已经患病的患者在日常生活中，则要定期监测疾病变化和及时复查。