(一)治疗
本病对化疗、放疗均不敏感，确诊后应行手术治疗，术式根据肿瘤大小、部位、有无转移而定。肿瘤切除率较高，有人报道切除率高达95%胃平滑肌肉瘤应根据病变的范围作手术切除。较小的肉瘤可以距离瘤缘3cm以上作局部广泛的切除。较大的肉瘤应作胃大部或全胃切除以及胃周淋巴结的切除术。因为胃平滑肌肉瘤瘤体有时生长很快，但很少侵犯邻近器官，因此尽量争取手术切除，常可取得较满意的效果。若肝内有孤立性转移瘤，而且病人一般情况尚好，能耐受手术者，可以行胃部分切除术及肝脏转移瘤的局部切除，亦能获得较满意的姑息疗效。常采用以下术式：
1.楔形胃切除 适用于小于5cm或良性肌瘤恶变可疑者。切缘定在2～3cm以上，缝合切缘，不改变消化道解剖生理结构。
2.胃大部切除术 适用于肿块大于5cm，小于10cm，或肿块靠近贲门或幽门，切缘应距肿瘤5cm以上。
3.全胃切除术 适用于肿块侵犯大部分胃者，切除全胃及网膜。
4.整块切除 适用于胃外有侵犯者。手术切除胃壁及胃外所有肉眼可见肿瘤及周围一定范围内组织，然后根据情况重建消化道，应尽量符合消化道生理解剖结构。
5.复发肿瘤 即使手术切除困难，仍可尝试手术切除，应尽量切除肿瘤及受累脏器。
化疗及放射治疗对胃平滑肌肉瘤均不敏感。
切除后的5年生存率为35～50%。
(二)预后
胃平滑肌肉瘤5年生存率为20%～54%，国外文献报道，肿瘤低度恶性者5年生存率81%，高度恶性者为32%。国内学者统计，胃平滑肌肉瘤病理分级1级者5年生存率为46.8%，2级为26.9%，3级为16.7%，病理组织学分级对预后有重要影响。
一般认为，胃平滑肌肉瘤的手术治疗效果较好，术后的5年生存率为50%左右。Shiu对胃平滑肌肉瘤的自然病程和预后因素作了研究，指出肿瘤的恶性程度分级、大小及有无邻近组织脏器浸润三者与患者的预后关系密切。认为这三个因素能客观反映肿瘤的生物学行为，并据此将胃平滑肌肉瘤分为三期。在三个因素中，除病理分级需经病理检查后确定，另两项则可通过手术探查作出判断。因此，该分期有助于治疗方案的选择和对预后作出评价，目前为一些学者所采用。
另外，胃平滑肌肉瘤预后还与下列因素有关：
1.大体类型，以壁间型预后最好，随后分别为腔内型、腔内外型、腔外型。
2.肿瘤体积是否≥6cm。
3.有否远处转移或侵犯邻近组织。
4.胃黏膜有无溃疡出现。
随着分子生物学研究的深入，学者们指出rasp21过度表达，DNA为异倍体的患者预后较rap21低表达，DNA二倍体者明显变差。