虽然咳嗽变异性哮喘通常没有生命危险，但由于咳嗽变异性哮喘可以发展为典型哮喘，且本病可以严重影响儿童的睡眠、休息和学习，因此应及早诊断并积极进行治疗。
一旦确诊为咳嗽变异性哮喘，应停止应用抗生素或抗病毒药物，同时应注意避免过敏原的接触。特别是对小儿咳嗽变异性哮喘实施哮喘病初级预防，旨在促进和加强Th1的细胞反应。
咳嗽变异性哮喘治疗原则和典型哮喘一样，主要以消除下呼吸道的过敏性炎症为主，包括脱敏治疗、抗变态反应药物、以及吸入糖皮质激素进行抗炎治疗，具体治疗方案如抗变态反应药物可采用左旋西替利嗪、地氯雷他定以及肥大细胞稳定剂如Nedocromil、色甘酸钠等也可以收到良好的效果，但往往需要持续应用2月以上。吸入糖皮质激素的剂量可参考轻度持续性哮喘的治疗方案。通常需要连续吸入5-7天，在气道炎症控制后，咳嗽症状可逐渐减轻或消失。吸入糖皮质激素的时间应至少持续3个月，以免复发。如果咳嗽较重，必要时可配合应用支气管扩张剂如吸入或口服β2受体兴奋剂或/和口服茶碱类药物，可以暂时缓解咳嗽症状。
对于停药后又反复发作的患儿应及时查清过敏原，采取有效的预防手段，必要时给予变应原疫苗治疗。
食疗方法
1.萝卜陈皮汤：白萝卜1个，切片放入白胡椒5粒，生姜10g，陈皮5g，煮汤，再加冰糖50g。用于小儿咳喘的早期，咳喘频繁发作，咽喉发痒，咳声重浊，痰白清稀。
2.罗汉果茶：广西罗汉果9g，水煎服。用于小儿咳喘不爽，痰黄粘稠，不容易咯出。
3.丝瓜汁：秋季丝瓜，取汁，隔水蒸热后饮用。用于小儿咳喘时间较长，痰多，色黄粘稠，咯吐不爽，或有热腥味。
4.川贝梨：川贝母5g，冰糖15g与梨同蒸，用于小儿咳喘痰多，色黄而粘稠。
5.薏苡仁山药冬瓜子粥：薏苡仁50g，山药、粳米各100g，冬瓜子50g，同煮粥食。用于小儿咳喘痰多，色白。
6.杏仁萝卜猪肺汤：猪肺、白萝卜各1个，切块，杏仁9g，共炖烂熟食。用于小儿久咳不愈、活动后气喘、气急者。
7.百合猪肺汤：百合30g，猪肺250g，炖熟加少许食盐调味，饮汤食猪肺。用于小儿咳喘时间较长，干咳少痰。冬天可以喝梨水，把鸭梨切成块，加些百合、具母、冰糖能够起到润肺、化痰、止咳作用。爱出汗的宝宝，冬3月可以服用黄芪大枣汤。配方为：黄芪（生）30克、大枣6-枚，水煎30分钟，取汁300毫升，分3天饮用。每次30毫升，每日3次，可以提高宝宝的免疫功能。除此以外，平日里可以给宝宝用黄芪、太子参、枸杞子褒汤喝，长期食用，有健脾、益肺功能，同时能调节宝宝机体免疫功能。冰糖2匙、川贝母11克、炖猪粉肠1段，服2次，可治疗痰稠燥咳。川贝梨：材料：梨、川贝母、冰糖或蜂蜜。作法：梨1个，削去顶尖，成1盖形，挖去核仁，纳入川贝母4克，加入少许冰糖或蜂蜜，将梨盖盖回，隔水加热炖熟为度。可以润肺止咳，治疗痰火胸痛及咳喘。
体虚过敏咳为主1、西洋参3片加红枣3枚（去核），以电饭锅蒸煮每日服用1次。2、猪腰1付、干姜8克，炖服，可治疗小儿体虚寒咳。3、四神汤：材料：莲子、薏仁、茯苓、山药、芡实各38克、猪肠半斤。做法：将莲子、薏仁、芡实先洗净泡水约2小时，再与茯苓、山药、洗净的猪肠一起炖煮。可以健脾补肾，促进食欲及肠胃吸收功能，尤其适合经常腹泻，疲倦气虚者。一般而言，咳喘的宝宝饮食应以清淡，应少食用咸、酸、辣等味道较重的食物，少食肯德基、麦当劳等高脂肪食品，少食过甜的东西，如巧克力、糖果等，更应该少吃冷饮及鱼类、海鲜等易发的食品。
以上是治疗小儿风寒咳喘的食疗方，家长在运用这些方法治病的同时，还应注意以下性寒凉的食物不能让孩子吃：绿豆、螃蟹、蚌肉、田螺、蜗牛、柿子、柚子、香蕉、猕猴桃、甘蔗、西瓜、甜瓜、苦瓜、荸荠、慈姑、海带、紫菜、生萝卜、茄子、芦蒿、藕、冬瓜、丝瓜、地瓜等。