由于很多家长对小儿梅克尔憩室疾病不了解，从而引起诊断或是治疗上很多错误，直到病情严重后才到医院检查，此时再采取治疗也较为困难，患者所承受的痛苦也会更多。那么小儿梅克尔憩室的治疗方法有哪些呢?
小儿梅克尔憩室的治疗原则为：不论诊断何种疾病，均应早期手术，切除憩室，才能彻底根治，有利病儿恢复健康。但憩室并发症在手术前很难做出正确诊断，只有在做阑尾炎或肠梗阻手术，或探查手术时，如未发现原拟诊断的病变，就应想到有否小儿梅克尔憩室引起的并发症，应探查距回盲部100CM以内之回肠。
如肠套叠手术复位时，也应注意回肠末段肠壁上有否小凹陷，是否为憩室内翻所致，仔细检查处理，否则易造成术后肠套叠早期复发。还有在处理索带、内疝、肠扭曲肠梗阻时，注意有否是小儿梅克尔憩室所引起的肠梗阻。明确诊断，有利于治疗。
在治疗小儿梅克尔憩室时，多因肠梗阻和溃疡出血引起水及电解质紊乱和血容量及血小板减少，憩室炎或穿孔引起腹膜炎，可致严重感染，因此术前因病人病情而异，做好充分的术前准备，以保证病儿以最佳状态接受手术治疗，切除憩室以获得良好的治疗效果。
（1）溃疡出血者：术前输血极为重要，以迅速纠正失血性休克，补充足够血容量，使血红蛋白恢复到9G以上，收缩压达到10.7KPA（80MMHG）以上，一般需准备6～12H，使病儿有足够的血容量才能不至在麻醉下缺氧，防止休克发生。
（2）憩室致肠梗阻：病儿来院时应立即作血气分析观察水及电解质有否失衡，及时纠正，严重者给予输血浆或全血，一般准备4～6H，如有绞窄梗阻者应及早手术。有腹胀、腹膜炎者应给予胃肠减压，有高热和中毒症状者，应给予物理降温及人工冬眠合剂。同时应用广谱抗生素。
（3）憩室炎或穿孔：应按阑尾炎或腹膜炎作术前准备。
小儿梅克尔憩室疾病经过治疗，疾病所发生的并发症也会跟着治愈。治疗后患者要注意饮食，患者宜吃容易消化的食物，要避免便秘，不然对疾病的恢复有阻碍，并且患者在治疗时还要注意休息，不宜好动，避免伤口裂开引起感染等。