女性性交疼痛的最主要及明显的症状即为性生活时出现的不同程度、不同性质的疼痛，也是患者就诊的主要原因。
1.疼痛的性质及部位先天性生殖器发育异常，如处女膜肥厚，处女膜伞、阴道闭锁、狭窄或短小、阴道纵隔或横隔，疼痛为表浅性钝性撞击痛，常伴有阴道插入困难;阴唇及阴道口粘连、瘢痕、外阴炎、前庭大腺炎、囊肿等常为局部烧灼样痛、锐痛或撞击时的疼痛;阴蒂或阴蒂包皮过敏时，疼痛呈牵拉性或接触性疼痛。肛门直肠疾病时，疼痛常呈弥漫性;阴道感染性疾病或阴道创伤及阴道萎缩时，由于缺乏雌激素等因素引起阴道、子宫颈内黏液的酸碱度改变，疼痛多在阴道口、阴道内，呈锐痛或轻度疼痛。子宫后倾或伴有子宫肌瘤，表现为月经前期深部性交疼痛。子宫内膜异位常致经前期性交疼痛，随性交动作而深部疼痛。慢性盆腔炎等盆腔病变时多为深部性交痛，而膀胱炎时常有随性交动作的阴道前壁性交痛;脂肪膨出也可引起性交时阴道前壁的疼痛。外阴皮肤由于性传播的疱疹性外生殖器炎症，性交时可引起阴道外部或内部灼痛;尖锐湿疣引起性交时外阴或阴道口烧灼样疼痛;其他如单纯疱疹、带状疱疹、阴虱、疥疮、皮炎等都可引起性交浅部疼痛。
2.相伴的器质性疾病症状如子宫内膜异位症，有典型的经期下腹部疼痛病史，疼痛呈进行性加重，盆腔检查时常有阴道后穹隆触痛、子宫或附件的压痛、宫颈的举痛、摇摆痛等，有时可触及内膜异位形成的巧克力囊肿;先天性无阴道、阴道短小或狭窄、阴道隔膜、处女膜闭锁或肥厚等，妇科检查时即可明确诊断;各种原因导致的外生殖器萎缩，有阴道干涩、外阴瘙痒、白带少，多有尿频、尿急、尿痛等泌尿道感染症状;检查时见外阴阴道皮肤、黏膜变薄，缺乏弹性，阴道分泌物减少或性状发生改变，常有反复发作的泌尿生殖道感染史;外阴阴道炎症包括螺旋体类性传播疾病(STDs)时，常有白带异常、外阴瘙痒，妇检见局部充血、红肿溃破及STDs典型的外阴疱疹或赘生物增生等病理损害;分娩、哺乳或绝经特殊生理事件的存在等其他疾病如精神病等的典型表现。
3.精神情绪表现患者可能述说“不想过性生活，只是尽做妻子的义务”、“害怕或讨厌房事”、“丈夫只顾自己的感受，动作又粗鲁、又不好对他说”、“就是说也说不清楚，有时还被误会为故意找理由躲避性生活”等类似的抱怨，消极对待夫妻性生活;患者情绪或低落、烦躁，或激动、敏感;夫妻关系不和谐，心理压力大;一般不主动谈及性生活问题，但经询问可发现可能因性知识及性经验的不足或缺乏存在的性功能障碍隐患;有些患者在妇检时不由自主地出现紧张焦虑、躯体后移、双腿内收或用手阻挡窥阴器或手的触碰而抗拒检查。
性交疼痛通常伴有明确的妇科疾病，因此医师要详细询问病史及各种社会心理相关因素，了解疼痛的起因、部位、持续时间及并发症状等。要详细进行妇科检查，含窥器检查、阴道检查和必要的三合诊检查，只有除外妇科及全身器质性相关疾病后，才能考虑社会心理因素。