新生儿呼吸暂停是一种比较严重的情况，主要是由于婴儿的呼吸中枢功能发育不全导致的，少数是由于感染、代谢紊乱，胃肠道功能异常而诱发的。婴儿出现呼吸暂停之后面部会出现发青或者发绀，同时心跳减慢，不及时治疗和可能导致脑部损伤等严重后果，以下几种药物对于治疗都有效果。
1.茶碱
茶碱和氨茶碱是治疗新生儿呼吸暂停最常用的药物。这两类药物属于甲基黄嘌呤类，其主要作用是抑制膦酸二脂酶，可以提高呼吸中枢对二氧化碳的敏感性，患儿在服用药物之后，呼吸中枢受到刺激，呼吸频率出现上升，缓解呼吸暂停的症状，但是这类药物容易引起心动过速和低血压的等后遗症，另外有胃肠道功能紊乱的情况禁止服用。
2.枸橼酸咖啡因
枸橼酸咖啡因主要用于治疗重症的原发性的新生儿呼吸暂停，其作用机制与氨茶碱类似，主要通过肌肉注射的方式给药，用量为20mg/kg体重，在第一次用药后的24小时之后需要再次用药，进行维持治疗，这类药物在婴儿体内的半衰期比较长，作用更为显著，但是由于其会与白蛋白结合，因此容易导致婴儿出现黄疸。
3.多沙普仑
多沙普仑主要用于治疗继发性的新生儿呼吸暂停，属于呼吸中枢兴奋药物 ，在服用之后可以提高呼吸中枢神经的活性，促进呼吸的能力，缓解缺氧症状。这类药物对于使用氨茶碱或者咖啡因治疗无效的患者效果明显。
4.肾上腺素
肾上腺素是一种激素类药物，主要利用人体内分泌的负反馈机制，加快患者的呼吸，提高氧气的供给量，同时促进血管的收缩，帮助婴儿恢复生命体征。
上述药物都是治疗新生儿呼吸暂停时经常使用的，对于症状比较严重的患者，还应该同时采取一些物理措施，首先需要对婴儿进行氧气支持，是血氧饱和度维持在90%左右。另外托起患儿的背部，或者是对前庭神经进行刺激也可以有效缓解呼吸暂停的情况，同时减轻由于缺氧对脑部的损伤。