囊尾蚴感染的不同阶段，可有不同的临床表现。
1.症状眼内囊尾蚴在早期幼虫很小时，或者虫体位于眼底周边部，此时患者多无自觉症状，当虫体生长增大时，会导致渐进性无痛性的视力减退。但寄生在眼底后极部的囊尾蚴，尤其是位于黄斑部者，常极早出现症状，病人主诉眼前可有逐渐增大的圆形或椭圆形暗影，视力减退，视物变形。寄生在视网膜下或局部视网膜脱离时可出现相应部位的视野缺损。视盘部位的囊尾蚴常引起象限性视野缺损。一般情况下，虫体因有囊膜包裹，患者可以耐受，一旦幼虫死亡，包囊内释放出的毒性产物会引起严重的葡萄膜及眼内炎症反应，睫状体充血并有疼痛感，视力极度下降甚至失明。玻璃体囊尾蚴由于虫体蠕动范围大，患者常能感觉到眼前有变形的类圆形球状阴影在游动，玻璃体混浊，有弥漫性的飞蚊症。
2.眼内所见用检眼镜及裂隙灯显微镜检查可发现眼内猪囊尾蚴的虫体及其相关病变。
(1)玻璃体内囊尾蚴：在玻璃体不太混浊的情况下，用检眼镜或裂隙灯三面镜检查可以发现玻璃体内有游动的球形或椭圆形灰白色半透明的囊体，囊壁光滑，边缘常有金黄色珍珠样的反光。仔细观察囊体可有自发性的蠕动，有时可看到呈三角形的头节伸出，在玻璃体内摆动。
(2)视网膜下囊尾蚴：在视网膜下可见一球形或椭圆形黄白色隆起，呈囊泡样，边界清楚，并有金黄色反光边缘，视网膜血管迂曲爬行于隆起的表面。隆起之周围可有视网膜水肿、渗出或小片出血，仔细观察可见囊体有蠕动感
(3)视网膜内囊尾蚴：囊体位于视网膜内界膜与视网膜神经纤维层之间，也称为视网膜前囊尾蚴。在视网膜表面可见一边界清楚的灰黄色囊泡样隆起，并有金黄色反光边缘。因内界膜的限制使囊体相对固定，无游走性，但仍有蠕动感。
(4)前房内囊尾蚴：裂隙灯显微镜可在前房内看到游动的虫体，伴随有较重的前部葡萄膜炎反应，以虹膜炎为主，睫状充血，前房有较多的KP及炎性细胞渗出，闪辉明显，刺激症状较重，视力显著下降。视盘部位的囊尾蚴，常来自中央动脉，寄生在视盘周围，会引起视盘水肿或变形,并伴有视野缺损。
眼内囊尾蚴最先波及到的是视网膜和玻璃体。除典型的囊体形态表现以外，常伴发有不同程度的玻璃体混浊变性，视网膜水肿、渗出及脱离等。玻璃体有灰白色尘埃状混浊，程度不等，严重的可发生膜状纤维增生，引起牵拉性视网膜脱离。视网膜下囊尾蚴还常因虫体游走，出现移位性视网膜脱离，虫体移至他处时，原处视网膜复位，新寄生部位又发生视网膜脱离。
3.全身所见寄生在体表的囊尾蚴可以在患者的眼睑或皮肤的皮下及肌肉内触及圆形或椭圆形的结节。数目不等，直径5～15mm。有时能自行消失，但又不断产生新的结节。若伴有脑部猪囊尾蚴，可出现头痛、头晕、癫痫等神经精神症状。若有肠道绦虫寄生，可在粪便中发现有白色节片。
根据裂隙灯显微镜及检眼镜眼底检查结果，依据囊尾蚴的特殊形态及蠕动现象即可诊断。但在玻璃体混浊或有严重葡萄膜炎反应时，对眼底无法窥视者，或因虫体周围水肿渗出较多，遮盖虫体，不能观察到蠕动，尤其是虫体死亡难以确定者，则需要作特殊检查以协助诊断。