应与骨髓炎，结核性关节炎相鉴别。胶乳粒子凝集以及协同凝集，特别是带有包囊的抗原，均可帮助鉴别如流感嗜血杆菌和肺炎球菌的诊断。其次需以下述不通类型的关节炎相鉴别。
1.关节结核：发病比较缓慢，有低热、盗汗，罕见有高热，局部有红肿，急性炎症表现不明显。
2.风湿性关节炎：常为多发性、游走性、对称性关节肿痛，也可有高热，往往伴有心脏病变;关节抽出液澄清，无细菌;愈后不留有关节功能障碍。
3.类风湿关节炎：儿童病例亦可有发热，但关节肿痛为多发性，往往可以超过3个以上，且呈对称性。部分病例为单关节型，鉴别困难。对抽出液做类风湿因子测定，阳性率高。
4.创伤性关节炎：没有发热，抽出液清或为淡血性，白细胞量少。
5.痛风以拇趾、跖趾关节对称性发作最为常见，夜间发作，亦可有发热。根据患病部位与血尿酸增高，可资鉴别。关节抽出液中找到尿酸钠盐结晶，具有诊断价值。