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肺炎链球菌败血症可继发于肺炎链球菌性肺炎、中耳炎、乳突炎、咽炎,病菌大多由肺部经引流淋巴径路经胸导管入血,中耳炎及乳突炎时则肺炎链球菌可经静脉窦入血,肺炎链球菌肺炎患者中,部分病例血培养阳性,阳性率随年龄增长而增加。脾切除患者发生较多,可能与脾脏的单核-吞噬细胞系统具有强大的吞噬与杀灭有荚膜的肺炎链球菌的功能有关。其他原有重症疾病(如镰状细胞贫血及免疫功能低下)患者,均易发生肺炎链球菌败血症。