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本病可分为原发性肺芽生菌病、慢性皮肤及骨骼芽生菌病、系统性芽生菌病和接种性芽生菌病4种类型。
原发性肺芽生菌病类似于肺结核或组织胞浆菌病,症状无特异性,某些病例极似原发性肺结核。多数可自愈,少数转为亚急性或慢性甚至播散至全身。T细胞功能障碍者,感染常十分严重,难以治愈,易播散至多脏器并迅速进展,广泛的双肺浸润和脑膜播散发生率高是其临床特征。