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并发症有高度营养不良、肺部继发感染、癫痫持续状态或心力衰竭等。自然过程常于6~9个月以内死于毒血症,脑膜脑炎可发生在早期,且进展迅速,但也有典型的睡眠病症状,尚未出现即死亡者。舞蹈病样动作与共济失调多见于儿童,随病情进展出现肌强直,嗜睡,继之昏睡,昏迷,并伴有全身瘙痒,此阶段脑脊液检查可见白细胞计数增加,末期多死于高度营养不良,肺部继发感染,癫痫持续状态或心力衰竭等。