宫颈原位癌的诊断遵循宫颈癌诊断的三阶梯程序，即细胞学检查、阴道镜指导下宫颈组织活检到宫颈锥切诊断。
1.细胞学检查 从1941年以来，阴道宫颈脱落细胞学诊断方法倍证实具有简便易行，经济有效及可以多次重复等特点，成为宫颈病变筛查的首选工具。宫颈脱落细胞学检查正确率有波动，且有一定的假阳性和假阴性。诊断的正确率和取材部位及方法，制片技术等因素有关。目前较普遍应用而且得到推荐的方法是液基薄层细胞学检查，可以减少杂质、血液等因素的干扰，提高诊断正确率。
2.阴道镜检查 阴道镜检查是诊断CIN和早期宫颈癌的重要的辅助诊断方法。阴道镜检查可以发现较隐秘的病变部位，提高检出率。在阴道镜检查的指导下活检，能够大大提高盲目活检的准确性。如果细胞学诊断和阴道镜检查结果不一致，必要时还可以行颈管搔刮术，明确颈管有无病灶的可能。
3.宫颈锥切 宫颈锥切是非常传统的诊断方法，由于阴道镜的应用得到普遍开展，此方法一度被忽视。经过不断的临床实践发现阴道镜指导下的宫颈活检仍然有其局限性，文献报道阴道镜指导下的宫颈活检诊断的正确率为75%到90%，除了检查者的经验、素质以外，还与检查技术本身的局限性有关，因此宫颈锥切被重新广泛应用。现在，由于Leep技术的推广，采用宫颈锥切得到更加普遍的应用
总之，由于宫颈病变的特点，大多数病例能够得到及时准确的诊断。需要强调的是，宫颈原位癌的诊断是建立在宫颈锥切病理诊断的基础之上，因此，严格说来，阴道镜指导下宫颈活检得到宫颈原位癌的诊断结论并不太可靠，宫颈锥切后的诊断更加可信。
