后壁穿孔性溃疡最为突出的表现为背痛。临床上顽固性十二指肠溃疡最常见的原因就是后壁十二指肠溃疡深入胰腺。若如此，则原来溃疡病疼痛的节律性和周期发生改变。开始时病人诉背痛，通常在下段胸椎和腰椎中线偏右一点。经常类似胰腺的放射痛。开始这种背痛伴随前腹壁的疼痛的出现而出现，服用牛奶或抗酸剂后可缓解，后来随着穿透的更深发展，这种背痛可能变得更持久而超过先前的溃疡痛。此时进食或服用抗酸剂不能缓解。尽管这种穿透性溃疡往往累及胰腺，但是很少引起出血性胰腺炎。也可能引起血清淀粉酶升高和典型的疼痛，但急性胰腺炎的临床表现少有出现。如果疼痛虽表现为顽固性，而只有轻微的背痛，此时分辨是否有穿透性溃疡比较困难。此时临床医生往往容易忽略该病的诊断，最好的办法是一旦病人有进食不能缓解的顽固性痛，就应考虑到此并发症。
有胃十二指肠溃疡病史和背痛可考虑本病诊断。如症状不典型，则有赖于内镜检查。X线钡餐检查也很有帮助，如果十二指肠球部只有轻微的变形而无明显瘢痕形成的表现，则不太考虑后壁穿透性溃疡;另一方面，明显地十二指肠球部变形而无确切溃疡后壁穿透的表现，都可能是胃后壁穿透的有利证据。另外血清淀粉酶的检测可能在某些情况下有些帮助。